More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4180 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  87.79 
 
 
435 aa  776    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  88.99 
 
 
427 aa  788    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  88.03 
 
 
435 aa  778    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  88.03 
 
 
435 aa  778    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  100 
 
 
427 aa  868    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  69.1 
 
 
433 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  68.71 
 
 
444 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  67.85 
 
 
430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  61.94 
 
 
426 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  60.71 
 
 
423 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  60.71 
 
 
423 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  60.71 
 
 
423 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  55.76 
 
 
426 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  55.76 
 
 
426 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  55.76 
 
 
426 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  54.93 
 
 
429 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  55.21 
 
 
428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  53.99 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  54.74 
 
 
423 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  54.74 
 
 
423 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  54.74 
 
 
423 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  53.44 
 
 
431 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  52.48 
 
 
425 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  52.25 
 
 
425 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  52.25 
 
 
425 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  51.54 
 
 
426 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  51.3 
 
 
426 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.76 
 
 
380 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.46 
 
 
392 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  31.28 
 
 
423 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  33.5 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3475  cytochrome P450  32.46 
 
 
403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218567  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  33.42 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  32.73 
 
 
401 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  32.73 
 
 
401 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.11 
 
 
398 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  33.42 
 
 
398 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.6 
 
 
388 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  31.41 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  31.41 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  32.45 
 
 
398 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3433  cytochrome P450  31.18 
 
 
406 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  32.11 
 
 
408 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  30.29 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  34.11 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  27.78 
 
 
403 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  33.42 
 
 
399 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  32.3 
 
 
406 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  32.47 
 
 
396 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  30.51 
 
 
395 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.7 
 
 
404 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.7 
 
 
404 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.7 
 
 
404 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.16 
 
 
407 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  31.99 
 
 
413 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.38 
 
 
417 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  34.46 
 
 
409 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1995  cytochrome P450  31.73 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37401  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  32.27 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.67 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  30.05 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  30.97 
 
 
413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  32.68 
 
 
400 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  32.68 
 
 
400 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  32.68 
 
 
400 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.4 
 
 
427 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  33.01 
 
 
414 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.7 
 
 
402 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.81 
 
 
404 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  32.38 
 
 
417 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  31.35 
 
 
398 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  32.75 
 
 
399 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  30.45 
 
 
393 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  28.74 
 
 
400 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  31.28 
 
 
430 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  31.36 
 
 
394 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  30.32 
 
 
400 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  31.36 
 
 
411 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.65 
 
 
418 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  29.79 
 
 
400 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  31.09 
 
 
418 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  29.79 
 
 
400 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  31.09 
 
 
406 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  31.09 
 
 
406 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.13 
 
 
412 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  31.03 
 
 
395 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  30.81 
 
 
395 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0702  hypothetical protein  47.8 
 
 
189 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  28.12 
 
 
401 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  27.76 
 
 
400 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.56 
 
 
398 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  30.62 
 
 
394 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  31.73 
 
 
417 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.08 
 
 
406 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  31.03 
 
 
405 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  37.07 
 
 
357 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  31.03 
 
 
405 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.19 
 
 
411 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  29.7 
 
 
413 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.19 
 
 
411 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>