More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0149 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0149  cytochrome P450  100 
 
 
383 aa  783    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1895  cytochrome P450  46.09 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1871  cytochrome P450  42.86 
 
 
379 aa  285  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5016  cytochrome P450  47.29 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14547  normal  0.304515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  42.74 
 
 
394 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  42.7 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  41 
 
 
386 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  41 
 
 
386 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0343  cytochrome P450  40.39 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0929  cytochrome P450  38.61 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19760  cytochrome P450  37.8 
 
 
392 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1012  cytochrome P450  34.25 
 
 
387 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  27.89 
 
 
412 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  27.09 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  28.45 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  28.57 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  25.99 
 
 
380 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  27.3 
 
 
407 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  27.88 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  29.14 
 
 
418 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  27.74 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  26.85 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  27.02 
 
 
419 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  28.3 
 
 
390 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  28.57 
 
 
387 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  27.67 
 
 
418 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  27.67 
 
 
418 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  27.67 
 
 
418 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  27.42 
 
 
406 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  27.66 
 
 
398 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  26.87 
 
 
404 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  26.87 
 
 
404 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  29.37 
 
 
774 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  25 
 
 
418 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  26.87 
 
 
404 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  26.87 
 
 
404 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  26.19 
 
 
396 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  26.2 
 
 
414 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  26.14 
 
 
405 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  25.42 
 
 
424 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  26.53 
 
 
404 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  27.64 
 
 
443 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  27.41 
 
 
398 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  28.75 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  26.53 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4477  cytochrome P450  28.12 
 
 
420 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752604  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  26.19 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  26.52 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  24.6 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  28.37 
 
 
390 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  27.97 
 
 
396 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  25.48 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  26.44 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  25.38 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  25.77 
 
 
436 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  26.25 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  29.08 
 
 
436 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  25.32 
 
 
403 aa  95.9  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  28.47 
 
 
400 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  28.77 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  26.46 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  27.36 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  29.63 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  27.37 
 
 
395 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  25.5 
 
 
412 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  26.95 
 
 
409 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  27.24 
 
 
1046 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  26.85 
 
 
433 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  28.48 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  26.69 
 
 
433 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  26.69 
 
 
433 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  25.62 
 
 
404 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  28.43 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  27.54 
 
 
461 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  26.98 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  29.49 
 
 
408 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  28.32 
 
 
399 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  28.18 
 
 
417 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  27.7 
 
 
407 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  24.62 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  25.84 
 
 
405 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  26.91 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  28.02 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  29.84 
 
 
408 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  25.39 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  27.42 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  28.48 
 
 
398 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  27.42 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2305  cytochrome P450  24.6 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.378524  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  27.44 
 
 
414 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  27.42 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  26.1 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  27.08 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  26.03 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  26.22 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  24.24 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  28.11 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  25.32 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.87 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  25.63 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>