More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2305 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2305  cytochrome P450  100 
 
 
385 aa  801    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.378524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  31.87 
 
 
418 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  30.77 
 
 
407 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  30.49 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  29.93 
 
 
405 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  29.7 
 
 
380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  29.1 
 
 
411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.1 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  28.76 
 
 
411 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  29.1 
 
 
411 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  29.1 
 
 
411 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  29.1 
 
 
411 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  30 
 
 
405 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  29.1 
 
 
411 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  31.91 
 
 
398 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  27.46 
 
 
421 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  28.76 
 
 
411 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  28.76 
 
 
411 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  28.76 
 
 
411 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  28.76 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  31.45 
 
 
399 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  30.31 
 
 
392 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  29.86 
 
 
399 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  33.21 
 
 
398 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  28.42 
 
 
402 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  30.74 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  30.17 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  29.29 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  29.07 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  29.02 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  28.96 
 
 
399 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4936  cytochrome P450  26.92 
 
 
451 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  27.97 
 
 
388 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5024  cytochrome P450  26.92 
 
 
451 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  27.11 
 
 
410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  28.57 
 
 
390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  29.14 
 
 
390 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  29.01 
 
 
401 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  30.41 
 
 
419 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  27.36 
 
 
403 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  28.9 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5317  cytochrome P450  27.48 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  26.93 
 
 
425 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  29.69 
 
 
417 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  28.44 
 
 
401 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  28.85 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  28.28 
 
 
418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  27.85 
 
 
420 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  28.16 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  30.9 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  29.25 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  29.25 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  29.25 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  27.99 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  29.53 
 
 
387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  29.85 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  27.74 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  29.9 
 
 
412 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  27.4 
 
 
411 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  28.76 
 
 
449 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  27.67 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  27.15 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2358  cytochrome P450  27.07 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4880  cytochrome P450  28.17 
 
 
450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  28.67 
 
 
404 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  28.71 
 
 
424 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  28.76 
 
 
404 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  28.21 
 
 
398 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  28.76 
 
 
404 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  25.67 
 
 
448 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  30.42 
 
 
418 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  30.42 
 
 
418 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  30.42 
 
 
418 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  25.81 
 
 
442 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  27.01 
 
 
418 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  28.48 
 
 
401 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  28.23 
 
 
420 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  27.7 
 
 
399 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  28.8 
 
 
394 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  29.5 
 
 
415 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  29.6 
 
 
443 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  27.64 
 
 
392 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  29.37 
 
 
404 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  27.57 
 
 
412 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  29.08 
 
 
408 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  27.95 
 
 
418 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  26.2 
 
 
403 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11220  cytochrome P450, putative (Eurofung)  26.15 
 
 
415 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  28.03 
 
 
410 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  30.13 
 
 
422 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  26.82 
 
 
422 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  27.41 
 
 
417 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  27.41 
 
 
417 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  28.57 
 
 
416 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  27.84 
 
 
434 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  25.74 
 
 
423 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  27.19 
 
 
387 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  27.54 
 
 
404 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  27.39 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  26.87 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>