More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2358 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2358  cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  29.07 
 
 
380 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.99 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  31.63 
 
 
412 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  29.67 
 
 
399 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  30.67 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  31.5 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  29.85 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  30.9 
 
 
415 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  28.69 
 
 
406 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  30.36 
 
 
399 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.39 
 
 
405 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.69 
 
 
410 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  35.92 
 
 
398 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  30.03 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  31.91 
 
 
421 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.73 
 
 
929 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2305  cytochrome P450  27.07 
 
 
385 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.378524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  31.25 
 
 
412 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  26.13 
 
 
411 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  27.84 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  26.84 
 
 
398 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  30 
 
 
425 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  30 
 
 
425 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  29.28 
 
 
402 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  30 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  30.77 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  29.02 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30.27 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  25.88 
 
 
411 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  26.92 
 
 
420 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  25.81 
 
 
411 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  30.23 
 
 
417 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.33 
 
 
419 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  25.81 
 
 
411 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  30.14 
 
 
407 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  25.56 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  30.14 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  30.14 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  29.78 
 
 
400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.17 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  26.45 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  25.31 
 
 
411 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  27.34 
 
 
411 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  25.31 
 
 
411 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  28.28 
 
 
399 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  26.81 
 
 
411 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.87 
 
 
400 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3499  cytochrome P450  28.12 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.750178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  26.8 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  32.08 
 
 
423 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  28.08 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  29.1 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  32.23 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  26.84 
 
 
412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  30.29 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  30.03 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  29.54 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  27.18 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  26.58 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  30.87 
 
 
414 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  28.79 
 
 
426 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  28.94 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  30.46 
 
 
395 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  29.03 
 
 
412 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  28.94 
 
 
386 aa  126  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  27.16 
 
 
411 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  27.6 
 
 
405 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  27.6 
 
 
405 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  30.41 
 
 
418 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.49 
 
 
411 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  26.96 
 
 
434 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  28.95 
 
 
416 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  29.73 
 
 
426 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  29.73 
 
 
426 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  29.73 
 
 
426 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  30.03 
 
 
404 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  28.61 
 
 
419 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  28.65 
 
 
417 aa  123  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  27.97 
 
 
394 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  31.19 
 
 
419 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  28.07 
 
 
404 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  27.95 
 
 
426 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  32.47 
 
 
400 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  30.79 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  30.03 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  27.88 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  29.89 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  29.05 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4845  cytochrome P450  31.68 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  30.14 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  28.35 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  28.12 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  27.39 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  32 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  26.84 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.57 
 
 
426 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.94 
 
 
411 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  31.05 
 
 
400 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  27.53 
 
 
420 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>