More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3499 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3499  cytochrome P450  100 
 
 
422 aa  850    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.750178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3974  cytochrome P450  52.33 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0514816  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  37.03 
 
 
398 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  37.6 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  31.25 
 
 
387 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.34 
 
 
380 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.93 
 
 
388 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.99 
 
 
398 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.73 
 
 
392 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.33 
 
 
436 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.6 
 
 
403 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  33.91 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  34 
 
 
409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.2 
 
 
407 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  33.42 
 
 
411 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.51 
 
 
417 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  32.9 
 
 
402 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.09 
 
 
410 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  27.98 
 
 
408 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.69 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.51 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  32.76 
 
 
406 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  31.92 
 
 
387 aa  167  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.25 
 
 
409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.08 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  31.2 
 
 
425 aa  166  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  32.77 
 
 
406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  28.24 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  33.93 
 
 
405 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  33.93 
 
 
405 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  38.57 
 
 
399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  34.47 
 
 
410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  34.15 
 
 
406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.72 
 
 
402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  29.79 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  27.46 
 
 
411 aa  163  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  34.72 
 
 
395 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  33.33 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.25 
 
 
426 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.25 
 
 
407 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  34.42 
 
 
423 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  32.35 
 
 
400 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  32.45 
 
 
408 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  31.08 
 
 
402 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  31.33 
 
 
405 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  28.61 
 
 
411 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  33.06 
 
 
405 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  31.98 
 
 
401 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  31.89 
 
 
405 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  31.89 
 
 
405 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  28.88 
 
 
418 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  29.46 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  33.33 
 
 
400 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  29.44 
 
 
407 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  29.44 
 
 
414 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  31.35 
 
 
402 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  31.35 
 
 
402 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  31.35 
 
 
402 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  29.53 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  31.44 
 
 
417 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  32.56 
 
 
413 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  27.91 
 
 
401 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  33.09 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  33.09 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  32.35 
 
 
427 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  32.35 
 
 
427 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  32.35 
 
 
427 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  28.57 
 
 
404 aa  156  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  32.44 
 
 
396 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  26.94 
 
 
411 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  28.76 
 
 
404 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  32.84 
 
 
395 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  34.68 
 
 
443 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  31.3 
 
 
412 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  28.76 
 
 
404 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  31.13 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  28.97 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  30.56 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  30.56 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  30.56 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3162  cytochrome P450  30.77 
 
 
430 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  31.85 
 
 
414 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  32.29 
 
 
412 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  32.9 
 
 
404 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  31.83 
 
 
400 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  34.37 
 
 
433 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.07 
 
 
406 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  32.55 
 
 
405 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  32.88 
 
 
413 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.75 
 
 
411 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  28.5 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  28.5 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  28.5 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  35.07 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  31.89 
 
 
433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  28.18 
 
 
411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  31.42 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  30.18 
 
 
390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  31.89 
 
 
433 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  31.89 
 
 
433 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>