More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5170 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  100 
 
 
426 aa  873    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  84 
 
 
425 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  84 
 
 
425 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  84 
 
 
425 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  90.61 
 
 
426 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  60.42 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  60.42 
 
 
429 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  57.14 
 
 
426 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  57.14 
 
 
426 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  57.14 
 
 
426 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  58.29 
 
 
423 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  58.29 
 
 
423 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  58.16 
 
 
423 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  52.96 
 
 
428 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  51.53 
 
 
430 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  52.8 
 
 
433 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  52.01 
 
 
431 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  52 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  51.77 
 
 
435 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  51.77 
 
 
435 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  51.54 
 
 
435 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  51.54 
 
 
427 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  49.88 
 
 
427 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  49.3 
 
 
423 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  49.3 
 
 
423 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  49.3 
 
 
423 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  48.1 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.55 
 
 
409 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.4 
 
 
380 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.02 
 
 
392 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.16 
 
 
417 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.07 
 
 
398 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  32.64 
 
 
407 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.25 
 
 
404 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.07 
 
 
398 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.83 
 
 
417 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  30.85 
 
 
395 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  34.83 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.08 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  31.53 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.99 
 
 
418 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  31.65 
 
 
399 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  31.28 
 
 
443 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.81 
 
 
388 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  28.68 
 
 
408 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0702  hypothetical protein  47.5 
 
 
189 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  30.89 
 
 
447 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  30.89 
 
 
447 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  30.89 
 
 
447 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.01 
 
 
426 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  28.6 
 
 
404 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  28.6 
 
 
404 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  28.6 
 
 
404 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  30.61 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  29.33 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  31.02 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  29.33 
 
 
464 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  28.57 
 
 
420 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  30.49 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  29.87 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  33.13 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  33.08 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  29.74 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.25 
 
 
405 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.74 
 
 
407 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.74 
 
 
407 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.74 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.03 
 
 
395 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  29.21 
 
 
403 aa  163  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  31.27 
 
 
400 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  29.64 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  29.64 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  29.64 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  29.54 
 
 
410 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  26.92 
 
 
403 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  33.25 
 
 
408 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  30.3 
 
 
400 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  31.08 
 
 
400 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  31.08 
 
 
400 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.94 
 
 
405 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  29.37 
 
 
402 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  32.21 
 
 
406 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  29.23 
 
 
412 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3475  cytochrome P450  30.05 
 
 
403 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218567  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  28.5 
 
 
422 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  30.62 
 
 
406 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  31.43 
 
 
402 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  31.89 
 
 
411 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  30.62 
 
 
406 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  32.94 
 
 
419 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  29.2 
 
 
417 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  30.03 
 
 
438 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  30.69 
 
 
417 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  29.62 
 
 
405 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  29.62 
 
 
405 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  29.62 
 
 
405 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  30.72 
 
 
411 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  30.39 
 
 
398 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  28.97 
 
 
398 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  30.3 
 
 
427 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>