More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2702 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  100 
 
 
394 aa  783    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3475  cytochrome P450  51.16 
 
 
403 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218567  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  49.1 
 
 
406 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  49.1 
 
 
406 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3433  cytochrome P450  48.84 
 
 
406 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  47.04 
 
 
406 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  33.76 
 
 
427 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  33.5 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.33 
 
 
412 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  31.17 
 
 
445 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  34.63 
 
 
426 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  33.01 
 
 
435 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  33.01 
 
 
435 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  32.78 
 
 
435 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  31.64 
 
 
428 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.33 
 
 
398 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  32.45 
 
 
433 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.7 
 
 
402 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  32.05 
 
 
417 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  33.6 
 
 
426 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  32.11 
 
 
444 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  31.71 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  33.6 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  33.6 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  29.38 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.67 
 
 
411 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  32.58 
 
 
402 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.08 
 
 
399 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  30.89 
 
 
430 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  33.06 
 
 
413 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.56 
 
 
398 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  31.3 
 
 
429 aa  159  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.52 
 
 
388 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  32.15 
 
 
406 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  27.2 
 
 
420 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  34.74 
 
 
409 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  31.96 
 
 
423 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  31.96 
 
 
423 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  31.96 
 
 
423 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  32.34 
 
 
400 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  31.92 
 
 
407 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  30.13 
 
 
399 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  34.58 
 
 
406 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  33.16 
 
 
450 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  32.49 
 
 
414 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  31.5 
 
 
414 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  33.69 
 
 
400 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  29.87 
 
 
399 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  32.92 
 
 
396 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  29.25 
 
 
414 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  33.75 
 
 
400 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.66 
 
 
392 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  29.5 
 
 
429 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.33 
 
 
408 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1995  cytochrome P450  32.23 
 
 
445 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37401  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  29.47 
 
 
413 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  32.22 
 
 
411 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.61 
 
 
409 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.56 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  34.67 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.63 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  30.67 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  32.38 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  32.38 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  32.81 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  29.37 
 
 
399 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  33.89 
 
 
395 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.83 
 
 
404 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  31.91 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  30.18 
 
 
402 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  32.12 
 
 
423 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.06 
 
 
407 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30.37 
 
 
426 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  29.54 
 
 
401 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  29.41 
 
 
402 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  31.79 
 
 
402 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  32.11 
 
 
425 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  31.48 
 
 
410 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  30.51 
 
 
407 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  31.75 
 
 
418 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  32.11 
 
 
425 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  30.3 
 
 
408 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  30.51 
 
 
407 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  28.71 
 
 
413 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  29.35 
 
 
380 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.11 
 
 
395 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  30.51 
 
 
407 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  31.12 
 
 
403 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  32.04 
 
 
426 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  32.7 
 
 
399 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  30.22 
 
 
410 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  30.97 
 
 
405 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  31.74 
 
 
402 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  28.75 
 
 
398 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  28.75 
 
 
398 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.47 
 
 
405 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  31.57 
 
 
419 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  28.75 
 
 
398 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  30.29 
 
 
389 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  31.04 
 
 
400 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>