More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1995 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1995  cytochrome P450  100 
 
 		 445 aa  905    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  59.53 
 
 		 445 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.95 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.41 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  33.82 
 
 		 407 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.57 
 
 		 398 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.33 
 
 		 405 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  32.86 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  33.49 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.5 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  30.75 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  32.13 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  31.73 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  30.39 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.88 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.32 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  31.72 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.7 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  31.43 
 
 		 423 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  31.43 
 
 		 423 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  31.43 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.01 
 
 		 399 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  31.78 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  33.67 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  32.74 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  32.78 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.42 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  34.72 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  30.14 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  30 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  29.9 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  29.9 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  29.9 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  30.77 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.94 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  30.4 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  29.19 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  32.2 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  28.85 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  32.48 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  30.28 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  30.28 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  28.92 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  28.95 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  28.95 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  33.09 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  30.23 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  30.05 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  31.12 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.16 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  34.22 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.43 
 
 		 929 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  28.09 
 
 		 411 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  33.11 
 
 		 387 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  29.52 
 
 		 408 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  31.1 
 
 		 409 aa  163  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  32.68 
 
 		 394 aa  163  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  31.7 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  32.04 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.1 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  32.94 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  31.65 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  27.96 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.27 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  27.85 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  32.67 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.81 
 
 		 409 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  31.3 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  30.27 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  32.47 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  31.1 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  32.12 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  33.41 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  32.39 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  31.15 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.14 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3974  cytochrome P450  33.33 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0514816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  35.76 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  29.95 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  32.96 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  33.24 
 
 		 418 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  31.59 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  33.24 
 
 		 409 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.76 
 
 		 398 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  30.97 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  32.37 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  31.28 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  32.23 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.49 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  35.09 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  33.7 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  30.59 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  33.7 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.63 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  30.59 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  33.7 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  29.17 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.79 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.57 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.13 
 
 		 407 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>