More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2020 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  100 
 
 
445 aa  912    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1995  cytochrome P450  59.53 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37401  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.87 
 
 
426 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  32.46 
 
 
433 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.53 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  33.49 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  30.14 
 
 
428 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  30.91 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  31.35 
 
 
444 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  31.17 
 
 
394 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.34 
 
 
420 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  30.95 
 
 
423 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.96 
 
 
399 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  31.31 
 
 
426 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  33.98 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  32.07 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  30.29 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.82 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  33.58 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  36.48 
 
 
413 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  30.22 
 
 
418 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  30.37 
 
 
403 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  30.55 
 
 
435 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  31.18 
 
 
406 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  29.75 
 
 
422 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  34.2 
 
 
390 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.66 
 
 
407 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  29.79 
 
 
431 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  33.42 
 
 
399 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  30.31 
 
 
435 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  30.31 
 
 
435 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  29.95 
 
 
426 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  29.95 
 
 
426 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  29.95 
 
 
426 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  29.52 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  29.52 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  29.33 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  30.7 
 
 
427 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  29.52 
 
 
425 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.15 
 
 
411 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.7 
 
 
402 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.07 
 
 
412 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  31.1 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  29.02 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  31.79 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  33.01 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  31.1 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  29.02 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.89 
 
 
412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  32.06 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  31.1 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  31.64 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  31.91 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  31.64 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  33.78 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  29.47 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3433  cytochrome P450  29.02 
 
 
406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  32.15 
 
 
402 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  31.18 
 
 
403 aa  163  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  32.66 
 
 
419 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  31.64 
 
 
423 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  31.55 
 
 
402 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  32.67 
 
 
400 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  31.1 
 
 
405 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  31.1 
 
 
405 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  27.94 
 
 
411 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  33.65 
 
 
439 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  30.94 
 
 
400 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  28.07 
 
 
408 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  29.09 
 
 
429 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  29.52 
 
 
426 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  31.48 
 
 
414 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  31.31 
 
 
407 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.32 
 
 
408 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  30.79 
 
 
405 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  30.38 
 
 
436 aa  159  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  31.83 
 
 
419 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.13 
 
 
380 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  33.33 
 
 
406 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  29.04 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  30.51 
 
 
412 aa  156  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  31.96 
 
 
418 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.01 
 
 
412 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  29.7 
 
 
411 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  31.18 
 
 
401 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  29.82 
 
 
387 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  29.23 
 
 
401 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.56 
 
 
404 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  32.66 
 
 
417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  31.18 
 
 
408 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  29.88 
 
 
411 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  30.58 
 
 
396 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  32.09 
 
 
447 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.32 
 
 
404 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  32.09 
 
 
447 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.32 
 
 
404 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  28.79 
 
 
404 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  32.09 
 
 
447 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  34.2 
 
 
417 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>