More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0597 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  100 
 
 
428 aa  875    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  59.24 
 
 
426 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  59.24 
 
 
426 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  59 
 
 
426 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  58.88 
 
 
429 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  58.18 
 
 
429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  59.07 
 
 
433 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  59.2 
 
 
444 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  56.88 
 
 
430 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  55.42 
 
 
423 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  55.42 
 
 
423 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  55.42 
 
 
423 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  56.47 
 
 
431 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  55.56 
 
 
435 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  55.56 
 
 
435 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  55.32 
 
 
435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  55.21 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  53.77 
 
 
425 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  54.87 
 
 
426 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  53.77 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  53.77 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  54.74 
 
 
427 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  52.96 
 
 
426 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  52.72 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  53.41 
 
 
423 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  53.41 
 
 
423 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  53.41 
 
 
423 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0702  hypothetical protein  66.32 
 
 
189 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.99 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.84 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  32.64 
 
 
406 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  32.64 
 
 
406 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3475  cytochrome P450  31.41 
 
 
403 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218567  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.85 
 
 
398 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3433  cytochrome P450  32.11 
 
 
406 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  31.29 
 
 
398 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  30.14 
 
 
445 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  31.94 
 
 
413 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.85 
 
 
398 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.89 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  30.61 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  31.64 
 
 
394 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  32.99 
 
 
404 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  32.99 
 
 
404 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  30.99 
 
 
398 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  32.99 
 
 
404 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  32.23 
 
 
402 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  30.95 
 
 
395 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  30.15 
 
 
398 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  26.2 
 
 
403 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  30.59 
 
 
411 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.64 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  35.1 
 
 
399 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30.77 
 
 
426 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1995  cytochrome P450  30.75 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37401  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.95 
 
 
409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.56 
 
 
427 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  30.79 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  30.47 
 
 
402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.75 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  30.37 
 
 
405 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  29.81 
 
 
782 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  31.4 
 
 
410 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  29.31 
 
 
396 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.68 
 
 
406 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  29.56 
 
 
401 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  30.88 
 
 
794 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.51 
 
 
407 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  28.2 
 
 
420 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  32.4 
 
 
400 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  29.7 
 
 
413 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  29.05 
 
 
407 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  29.05 
 
 
407 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  29.72 
 
 
399 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  29.05 
 
 
407 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  30.56 
 
 
401 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  32.14 
 
 
400 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  32.14 
 
 
400 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.24 
 
 
417 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  30.85 
 
 
395 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  29.05 
 
 
395 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.29 
 
 
411 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.42 
 
 
417 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  29.84 
 
 
401 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  29.84 
 
 
401 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  29.84 
 
 
401 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  28.64 
 
 
784 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  28.64 
 
 
784 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  28.64 
 
 
784 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  28.64 
 
 
784 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  28.64 
 
 
784 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  28.64 
 
 
784 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  28.64 
 
 
784 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  30.99 
 
 
464 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  29.77 
 
 
412 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  30.59 
 
 
399 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  28.6 
 
 
417 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  30.61 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  29.92 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  30.61 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>