More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3485 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  816    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3433  cytochrome P450  99.26 
 
 
406 aa  809    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  816    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  59.51 
 
 
406 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3475  cytochrome P450  59.64 
 
 
403 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218567  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  49.1 
 
 
394 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  33.33 
 
 
430 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  32.45 
 
 
426 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  33.1 
 
 
444 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  32.45 
 
 
426 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  32.45 
 
 
426 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  32.64 
 
 
428 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  32.3 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  32.3 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  32.3 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  31.41 
 
 
427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  33.25 
 
 
426 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  31.98 
 
 
433 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  31.52 
 
 
435 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  31.52 
 
 
435 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  31.28 
 
 
435 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  31.03 
 
 
427 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  33.77 
 
 
423 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  33.77 
 
 
423 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  33.77 
 
 
423 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.96 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  29.02 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  30.23 
 
 
429 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  32.16 
 
 
425 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  29.46 
 
 
429 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  31.91 
 
 
425 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  31.91 
 
 
425 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  30.62 
 
 
426 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.91 
 
 
409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  28.61 
 
 
402 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  28.61 
 
 
402 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  28.61 
 
 
402 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  31.23 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30 
 
 
404 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  28.8 
 
 
417 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30.79 
 
 
398 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  30.38 
 
 
413 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.47 
 
 
420 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  29.77 
 
 
399 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  28.71 
 
 
431 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  30.1 
 
 
399 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  29.43 
 
 
399 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  31.67 
 
 
395 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  30.52 
 
 
414 aa  149  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  31.28 
 
 
412 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  31.41 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  31.52 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  30.77 
 
 
489 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  29.32 
 
 
408 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  29.02 
 
 
398 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  30.75 
 
 
400 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  30.75 
 
 
400 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  29.85 
 
 
413 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  30.75 
 
 
400 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  30.05 
 
 
389 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  29.44 
 
 
401 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  32.3 
 
 
450 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  29.44 
 
 
401 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  28.87 
 
 
399 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  29.44 
 
 
401 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  27.4 
 
 
380 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  28.65 
 
 
402 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  30.54 
 
 
417 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  28.38 
 
 
402 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  29.9 
 
 
412 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  28.69 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  31.27 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  29.57 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  28.43 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  28.32 
 
 
436 aa  141  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  31.63 
 
 
407 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  28.07 
 
 
393 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  31.2 
 
 
392 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  28.49 
 
 
403 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  28.26 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  29.23 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  28.83 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  30.27 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  28.99 
 
 
412 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  31.21 
 
 
421 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  28.91 
 
 
398 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  29.66 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  30.5 
 
 
407 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.02 
 
 
395 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  27.99 
 
 
411 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  32.04 
 
 
404 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  29.94 
 
 
399 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  27.99 
 
 
394 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  30.19 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  27.66 
 
 
412 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  30.87 
 
 
431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  29.52 
 
 
399 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  28.53 
 
 
405 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>