288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0702 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0702  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  386  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  66.32 
 
 
428 aa  256  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  59.63 
 
 
429 aa  195  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  58.39 
 
 
429 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  58.39 
 
 
433 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  54.78 
 
 
426 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  54.78 
 
 
426 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  54.78 
 
 
426 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  56.33 
 
 
444 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  55.41 
 
 
431 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  44.39 
 
 
426 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  53.16 
 
 
430 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  48.75 
 
 
425 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  48.75 
 
 
425 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  48.75 
 
 
425 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  47.5 
 
 
426 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  50.63 
 
 
423 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  50.63 
 
 
423 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  50.63 
 
 
423 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  50.96 
 
 
426 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  50.93 
 
 
423 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  50.93 
 
 
423 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  50.93 
 
 
423 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  49.69 
 
 
435 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  49.69 
 
 
435 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  49.69 
 
 
435 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  47.8 
 
 
427 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  48.43 
 
 
427 aa  157  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  37.84 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  39.01 
 
 
406 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  31.72 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.12 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.61 
 
 
398 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  31.72 
 
 
414 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  30.77 
 
 
413 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  29.22 
 
 
410 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  30.97 
 
 
412 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.12 
 
 
417 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.91 
 
 
409 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  31.65 
 
 
389 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  28.05 
 
 
395 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3269  cytochrome P450  28.1 
 
 
410 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.22 
 
 
388 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  31.85 
 
 
404 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  30.82 
 
 
410 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  28.77 
 
 
409 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  28.8 
 
 
411 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  32.03 
 
 
419 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  26.71 
 
 
405 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  30.87 
 
 
784 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  31.9 
 
 
408 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  32.89 
 
 
417 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  31.94 
 
 
401 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  28.97 
 
 
380 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.06 
 
 
406 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  29.33 
 
 
410 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  29.69 
 
 
425 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  30.66 
 
 
788 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  28.28 
 
 
402 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  28.67 
 
 
783 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.58 
 
 
422 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  28.28 
 
 
402 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  28.28 
 
 
402 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  24.84 
 
 
392 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  31.97 
 
 
408 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  30.2 
 
 
412 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  30.07 
 
 
421 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  26.57 
 
 
427 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  26.49 
 
 
402 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  30.43 
 
 
405 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  27.89 
 
 
404 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  26.8 
 
 
408 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2520  putative cytochrome P450  30.22 
 
 
399 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902578  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  31.47 
 
 
423 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  27.89 
 
 
404 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  27.62 
 
 
396 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  29.19 
 
 
400 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  31.18 
 
 
392 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  29.86 
 
 
398 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  26.28 
 
 
411 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  27.89 
 
 
404 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  30.56 
 
 
402 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  29.86 
 
 
398 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.3 
 
 
783 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  28.68 
 
 
418 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  27.17 
 
 
402 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  27.5 
 
 
418 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  29.93 
 
 
414 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  29.37 
 
 
402 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  29.22 
 
 
445 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  33.1 
 
 
418 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  28.28 
 
 
782 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  28.29 
 
 
407 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  28.29 
 
 
407 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2686  Cytochrome P450-like protein  26.9 
 
 
387 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.0564273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  30.56 
 
 
414 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  28.29 
 
 
407 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  28.99 
 
 
784 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  28.99 
 
 
784 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  28.99 
 
 
784 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>