More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3475 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3475  cytochrome P450  100 
 
 
403 aa  814    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218567  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  59.64 
 
 
406 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  59.64 
 
 
406 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3433  cytochrome P450  59.39 
 
 
406 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  56.7 
 
 
406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  51.16 
 
 
394 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  33.57 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  32.06 
 
 
426 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  33.66 
 
 
444 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  32.47 
 
 
433 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  33.1 
 
 
423 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  33.1 
 
 
423 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  33.1 
 
 
423 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  30.55 
 
 
426 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  30.55 
 
 
426 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  30.55 
 
 
426 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  31.41 
 
 
428 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  32.46 
 
 
427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  31.65 
 
 
435 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  31.65 
 
 
435 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  32.3 
 
 
435 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  32.55 
 
 
427 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.97 
 
 
388 aa  166  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  31.26 
 
 
423 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  31.26 
 
 
423 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  31.03 
 
 
423 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  30.05 
 
 
426 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  31.15 
 
 
417 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  28.42 
 
 
429 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  28.16 
 
 
429 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  28.64 
 
 
431 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  31.42 
 
 
404 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  31.42 
 
 
404 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  31.98 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  31.42 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  30.05 
 
 
425 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  29.51 
 
 
408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  30.79 
 
 
399 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  31.28 
 
 
400 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  29.81 
 
 
425 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  29.41 
 
 
426 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  29.81 
 
 
425 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  31.02 
 
 
400 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  31.02 
 
 
400 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.79 
 
 
392 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  27.96 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.88 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  30.38 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  30.03 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  30.38 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  30.38 
 
 
401 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  31.54 
 
 
398 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  29.33 
 
 
414 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.65 
 
 
395 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  30.65 
 
 
427 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  27.85 
 
 
445 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.85 
 
 
420 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  29.35 
 
 
409 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  31.11 
 
 
399 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  33.99 
 
 
407 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  30.5 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.7 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  29.68 
 
 
395 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  30.81 
 
 
403 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  28.03 
 
 
402 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  28.03 
 
 
402 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  29.68 
 
 
413 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  28.03 
 
 
402 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  29.81 
 
 
395 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  29.51 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  30.3 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  28.3 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  29.75 
 
 
450 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  30.41 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4477  cytochrome P450  34.56 
 
 
420 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752604  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  29.75 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  29.43 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  27.37 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  32.59 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  28.53 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  30.6 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  29.03 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  28.1 
 
 
397 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  28.1 
 
 
397 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  29.25 
 
 
404 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  28.1 
 
 
397 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  29.88 
 
 
416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  30.28 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  26.92 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  31.83 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  29.27 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  29.19 
 
 
398 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  29.84 
 
 
412 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  29.27 
 
 
411 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  28.57 
 
 
405 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  27.89 
 
 
393 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  26.68 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  28.61 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  31.06 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  28.64 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>