More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  100 
 
 
423 aa  875    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  31.28 
 
 
427 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.34 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  29.9 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  28.57 
 
 
403 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  28.99 
 
 
407 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  30.95 
 
 
445 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  31.05 
 
 
435 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  31.05 
 
 
435 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  31.05 
 
 
435 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  31.76 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  28.86 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  29.3 
 
 
402 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  29.91 
 
 
427 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  31.51 
 
 
392 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  32.51 
 
 
398 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  29.1 
 
 
402 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  28.95 
 
 
402 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  29.44 
 
 
405 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.4 
 
 
418 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  30 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  28.8 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  28.07 
 
 
423 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  30.79 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  30.79 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  29.52 
 
 
405 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  29.52 
 
 
405 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  30.91 
 
 
406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  30.94 
 
 
401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  27.94 
 
 
411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  30.29 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  30.29 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  28.68 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  30.29 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  30.53 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  31.19 
 
 
390 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  27.85 
 
 
411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30.18 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  30.4 
 
 
428 aa  163  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  29.56 
 
 
409 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  31.03 
 
 
407 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.08 
 
 
404 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.08 
 
 
404 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.08 
 
 
404 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  31.65 
 
 
418 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  29.95 
 
 
420 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  30.2 
 
 
408 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  28.99 
 
 
423 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  30.39 
 
 
444 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  28.76 
 
 
402 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  28.5 
 
 
412 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  28.76 
 
 
402 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  28.76 
 
 
402 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  29.6 
 
 
449 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  27.82 
 
 
411 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  28.74 
 
 
423 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  28.74 
 
 
423 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  30.02 
 
 
417 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  28.05 
 
 
415 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  33.85 
 
 
395 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  28.17 
 
 
411 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  27.66 
 
 
420 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.48 
 
 
395 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  28.85 
 
 
406 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  28.87 
 
 
408 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  28.72 
 
 
430 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  30.1 
 
 
409 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  32.33 
 
 
433 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  29.87 
 
 
400 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  29.52 
 
 
426 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  29.37 
 
 
405 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  33.66 
 
 
438 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  29.37 
 
 
405 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  29.37 
 
 
405 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  28.19 
 
 
405 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  26.52 
 
 
408 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  29.43 
 
 
404 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  28.9 
 
 
412 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  29.79 
 
 
413 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  27.15 
 
 
426 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  30.24 
 
 
443 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  27.15 
 
 
426 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  27.46 
 
 
411 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  27.15 
 
 
426 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.57 
 
 
426 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  29.72 
 
 
421 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  28.95 
 
 
400 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  27.63 
 
 
431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  29.26 
 
 
426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  26.68 
 
 
411 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  28.22 
 
 
436 aa  156  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  29.32 
 
 
399 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  30.58 
 
 
402 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  29.3 
 
 
401 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4984  cytochrome P450  32.69 
 
 
409 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  30.97 
 
 
392 aa  156  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  29.63 
 
 
393 aa  156  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  28.4 
 
 
401 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  28.79 
 
 
408 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0363  cytochrome P450  32.92 
 
 
409 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>