More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3420 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3420  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  826    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00557634  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  38.01 
 
 
406 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.57 
 
 
418 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  34.34 
 
 
425 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  36.5 
 
 
400 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4494  cytochrome P450  36.25 
 
 
427 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  34.24 
 
 
414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  35.71 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.1 
 
 
404 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  35.45 
 
 
412 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  32.1 
 
 
417 aa  202  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  34.03 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  34.03 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  34.03 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  34.02 
 
 
416 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  32.53 
 
 
414 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  31.96 
 
 
418 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  33.5 
 
 
416 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  33.5 
 
 
416 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  34.47 
 
 
427 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  33.5 
 
 
428 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  33.9 
 
 
415 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  33.17 
 
 
414 aa  193  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  32.84 
 
 
401 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  33.42 
 
 
409 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  33.42 
 
 
412 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  33.16 
 
 
412 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  32.2 
 
 
402 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  36.04 
 
 
395 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  32.63 
 
 
420 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  34.38 
 
 
433 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  28.99 
 
 
419 aa  186  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  32.03 
 
 
402 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  32.03 
 
 
402 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  32.7 
 
 
422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  32.06 
 
 
409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  32.62 
 
 
420 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  32.62 
 
 
420 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  32.62 
 
 
420 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  30.1 
 
 
407 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  34.06 
 
 
427 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  32.66 
 
 
395 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  34.06 
 
 
427 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  33.08 
 
 
395 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  34.06 
 
 
427 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  35.48 
 
 
434 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.9 
 
 
388 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  29.93 
 
 
447 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.73 
 
 
395 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  32.74 
 
 
419 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  30.54 
 
 
408 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  30.79 
 
 
408 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.04 
 
 
401 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  30.6 
 
 
398 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  30.2 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  31.05 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  31.05 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  30.24 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  31.85 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.68 
 
 
398 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  31.55 
 
 
407 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  30.81 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  31.11 
 
 
449 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  31.73 
 
 
415 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  29.79 
 
 
437 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.16 
 
 
405 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  32.74 
 
 
420 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.25 
 
 
406 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.43 
 
 
426 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  32.67 
 
 
434 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.51 
 
 
380 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.67 
 
 
402 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.15 
 
 
399 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  33.79 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4553  cytochrome P450  30.81 
 
 
404 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174977  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.92 
 
 
398 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.03 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  31.37 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  29.6 
 
 
410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  32.61 
 
 
407 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.02 
 
 
417 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  32.2 
 
 
428 aa  166  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  29.9 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  31.59 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  28.16 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  31.59 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  31.73 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  27.27 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  31.59 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  31.81 
 
 
404 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  31.08 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  29.93 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  30.22 
 
 
416 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  32.37 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  31.13 
 
 
433 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  29.77 
 
 
408 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  30.13 
 
 
410 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  29.68 
 
 
423 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  29.68 
 
 
423 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  32.36 
 
 
414 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>