More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4494 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4494  cytochrome P450  100 
 
 
427 aa  846    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  36.59 
 
 
425 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  37.62 
 
 
421 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  35.56 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3420  cytochrome P450  36.25 
 
 
406 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00557634  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  32.86 
 
 
419 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  38.77 
 
 
406 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  36.01 
 
 
414 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  36.96 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  35.77 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  34.7 
 
 
413 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  34.7 
 
 
413 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  34.7 
 
 
413 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  32.52 
 
 
428 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  33.42 
 
 
417 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  32.52 
 
 
416 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  32.52 
 
 
416 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  33.83 
 
 
418 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4553  cytochrome P450  33.66 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174977  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  33.68 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  34.2 
 
 
419 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  34.43 
 
 
400 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  37.72 
 
 
406 aa  199  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  33.49 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  33.49 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  32.61 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  32.13 
 
 
433 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  33.25 
 
 
420 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  33.75 
 
 
401 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  34.96 
 
 
414 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  33.09 
 
 
408 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  31.78 
 
 
418 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  32.86 
 
 
420 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.03 
 
 
404 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  33.16 
 
 
412 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  31.32 
 
 
420 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  32.93 
 
 
449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  31.97 
 
 
408 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  34.11 
 
 
409 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  35.12 
 
 
422 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  33.63 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  30.52 
 
 
408 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  31.84 
 
 
423 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  31.84 
 
 
423 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  29.95 
 
 
424 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  34.47 
 
 
409 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  35.7 
 
 
407 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  28.88 
 
 
418 aa  177  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  31.84 
 
 
423 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  31.09 
 
 
403 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  29.5 
 
 
411 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  29.5 
 
 
411 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  30.75 
 
 
401 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  31.88 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2608  cytochrome P450 family protein  30 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  30 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  32.28 
 
 
412 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  36.15 
 
 
387 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.83 
 
 
388 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  30.96 
 
 
403 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  34.13 
 
 
402 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  34.13 
 
 
402 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  33.05 
 
 
417 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  33.25 
 
 
415 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  33.7 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  33.25 
 
 
402 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7766  cytochrome P450  30 
 
 
430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  30.6 
 
 
419 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.42 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  29.88 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.71 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  33.58 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  31.94 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  27.3 
 
 
411 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  32.38 
 
 
436 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  32.85 
 
 
427 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  32.85 
 
 
427 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  32.85 
 
 
427 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  30.29 
 
 
463 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  30.84 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  30.84 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  30.84 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.51 
 
 
408 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  27.62 
 
 
408 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  28.54 
 
 
433 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  30.02 
 
 
447 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  32.17 
 
 
398 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  32.53 
 
 
422 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.23 
 
 
402 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  33.58 
 
 
433 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  28.75 
 
 
410 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  34.38 
 
 
406 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  33.7 
 
 
424 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  33.7 
 
 
424 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  33.7 
 
 
424 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  30.68 
 
 
413 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  32.13 
 
 
404 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  29.85 
 
 
420 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  31.78 
 
 
428 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  32.29 
 
 
406 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>