More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3425 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  100 
 
 
421 aa  836    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  49.88 
 
 
407 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  48.74 
 
 
425 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4553  cytochrome P450  37.41 
 
 
404 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174977  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4494  cytochrome P450  37.62 
 
 
427 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  34.51 
 
 
417 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  35.48 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  36.2 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  34 
 
 
408 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  32.52 
 
 
408 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  35.75 
 
 
415 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  35.59 
 
 
409 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.19 
 
 
418 aa  206  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  32.2 
 
 
418 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  34.46 
 
 
401 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  34.98 
 
 
406 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  31.2 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  34 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  35.56 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  34 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  31.7 
 
 
410 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  32.43 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  33.51 
 
 
424 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  33.58 
 
 
414 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  34.02 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  33.83 
 
 
402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  31.96 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  34.65 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  34.04 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  32.68 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  29.24 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  32.32 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  29.24 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  30.05 
 
 
411 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  35.64 
 
 
424 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  32.35 
 
 
423 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  32.1 
 
 
423 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  32.1 
 
 
423 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  30.12 
 
 
414 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  31.51 
 
 
419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  32.82 
 
 
433 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  29.03 
 
 
433 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  32.22 
 
 
414 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  33.16 
 
 
434 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  34.76 
 
 
415 aa  189  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  32.2 
 
 
412 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  29.07 
 
 
419 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  29.32 
 
 
420 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  32.01 
 
 
417 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  32.92 
 
 
413 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  29.43 
 
 
427 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  32.92 
 
 
413 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  29.43 
 
 
427 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  29.43 
 
 
427 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  32.92 
 
 
413 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  30.6 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  32.56 
 
 
442 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  33.68 
 
 
417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  31.22 
 
 
433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.99 
 
 
401 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  31.71 
 
 
419 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  33.43 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  33.43 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  33.43 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  31.53 
 
 
422 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  33.41 
 
 
434 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  29.85 
 
 
419 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  33.25 
 
 
417 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  30.75 
 
 
416 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  33.25 
 
 
417 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  31.68 
 
 
416 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  31.68 
 
 
416 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  33.25 
 
 
417 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  32.33 
 
 
428 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  32.03 
 
 
408 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  30.14 
 
 
413 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  30.24 
 
 
398 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.9 
 
 
388 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  31.95 
 
 
403 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  33.41 
 
 
431 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  31.72 
 
 
420 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  32.56 
 
 
421 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  28.39 
 
 
387 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  29.77 
 
 
380 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.63 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  30.85 
 
 
416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3420  cytochrome P450  30.24 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00557634  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  32.78 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  31.46 
 
 
421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  31.23 
 
 
420 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  33.5 
 
 
425 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  30.58 
 
 
420 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.29 
 
 
398 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  31.97 
 
 
421 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  31.39 
 
 
449 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  30.58 
 
 
420 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.12 
 
 
404 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  30.58 
 
 
420 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  29.88 
 
 
404 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  29.88 
 
 
404 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>