More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6337 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  100 
 
 
315 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  50.65 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  50.65 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  48.43 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  50.83 
 
 
328 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  48.87 
 
 
333 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  46.67 
 
 
316 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  49.02 
 
 
774 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  44.34 
 
 
321 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  42.19 
 
 
319 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  41.94 
 
 
788 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  43.93 
 
 
788 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  48.64 
 
 
782 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  45.7 
 
 
783 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  45.18 
 
 
780 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  43.18 
 
 
315 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  43.18 
 
 
315 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  43.18 
 
 
315 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  43.19 
 
 
784 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  44.88 
 
 
784 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  44.55 
 
 
783 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  44.88 
 
 
784 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  44.88 
 
 
784 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  44.88 
 
 
784 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  43.99 
 
 
368 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  44.55 
 
 
784 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  44.88 
 
 
784 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  42.16 
 
 
657 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  44.88 
 
 
784 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  38.1 
 
 
322 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  43.99 
 
 
368 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  43.99 
 
 
368 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  45.7 
 
 
794 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  40.13 
 
 
316 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  40.13 
 
 
316 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.8 
 
 
318 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  39.31 
 
 
320 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  40.57 
 
 
321 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  40.25 
 
 
321 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  40.25 
 
 
321 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  44.76 
 
 
775 aa  219  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  42.06 
 
 
385 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  43.41 
 
 
351 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  40.32 
 
 
327 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  40.49 
 
 
379 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  38.51 
 
 
320 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  42.57 
 
 
365 aa  215  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  40.19 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  38.89 
 
 
319 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  38.99 
 
 
321 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  38.63 
 
 
320 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  37.74 
 
 
321 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  38.01 
 
 
321 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  38.24 
 
 
319 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  40 
 
 
324 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  36.16 
 
 
322 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  35.83 
 
 
326 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.99 
 
 
321 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.89 
 
 
322 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.94 
 
 
316 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  36.91 
 
 
323 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  37.14 
 
 
319 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.41 
 
 
317 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  35.51 
 
 
322 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  36.02 
 
 
323 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  37.05 
 
 
316 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  36.72 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  37.35 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  36.72 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  37.19 
 
 
322 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  36.1 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.94 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.62 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  38.08 
 
 
318 aa  198  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  38.16 
 
 
319 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  42 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  35.87 
 
 
321 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  37.19 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.39 
 
 
315 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  35.02 
 
 
320 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  36.05 
 
 
1069 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  38.15 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  34.59 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  34.59 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  37.85 
 
 
321 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  38.82 
 
 
769 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.85 
 
 
321 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  37.85 
 
 
321 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  37.85 
 
 
321 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.85 
 
 
321 aa  188  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12789  oxidoreductase  39.29 
 
 
363 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.315864  normal  0.803284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.85 
 
 
321 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  37.35 
 
 
330 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 
321 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  38.03 
 
 
330 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  36.14 
 
 
323 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  36.79 
 
 
315 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  35.2 
 
 
321 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  36.57 
 
 
322 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.73 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>