More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2306 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  100 
 
 
315 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  100 
 
 
315 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  100 
 
 
315 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  49.36 
 
 
333 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  45.62 
 
 
316 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  45.62 
 
 
316 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  50.48 
 
 
774 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  45.94 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  45.82 
 
 
328 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  47.98 
 
 
331 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  44.3 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  44.3 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  43.44 
 
 
321 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  42.32 
 
 
319 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  43.18 
 
 
315 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  46.18 
 
 
784 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  43.04 
 
 
788 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  46.1 
 
 
368 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  41.32 
 
 
316 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  46.1 
 
 
368 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  46.1 
 
 
368 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  46.2 
 
 
657 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  42.9 
 
 
322 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.72 
 
 
322 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12789  oxidoreductase  44.59 
 
 
363 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.315864  normal  0.803284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  40.44 
 
 
320 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  46.89 
 
 
365 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  42.41 
 
 
318 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.75 
 
 
313 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  40.62 
 
 
322 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  40.06 
 
 
319 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  40.44 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.55 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  41.25 
 
 
379 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  44.92 
 
 
351 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  39.75 
 
 
788 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  44.72 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  41.25 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  39.43 
 
 
780 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  43.85 
 
 
784 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  43.85 
 
 
784 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  43.85 
 
 
784 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  43.85 
 
 
784 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  43.85 
 
 
784 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  43.85 
 
 
784 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  43.53 
 
 
784 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  42.45 
 
 
783 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  42.11 
 
 
321 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  42.11 
 
 
321 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.08 
 
 
317 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.94 
 
 
783 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  41.23 
 
 
782 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  41.03 
 
 
321 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  42.9 
 
 
321 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  41.49 
 
 
323 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  41.1 
 
 
385 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  42.28 
 
 
321 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  37.81 
 
 
320 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  41.49 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  36.76 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  37.96 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  38.32 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  39.38 
 
 
326 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  40.73 
 
 
318 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  40 
 
 
325 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  41.64 
 
 
327 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  39.76 
 
 
332 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.18 
 
 
321 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  38.94 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  38.18 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  39.32 
 
 
588 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  41.8 
 
 
775 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  38.56 
 
 
794 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  38.67 
 
 
321 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  38.67 
 
 
321 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  39.67 
 
 
316 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  38.67 
 
 
321 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  38.37 
 
 
321 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  39.09 
 
 
316 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.24 
 
 
331 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  39.09 
 
 
316 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  39.94 
 
 
352 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  38.39 
 
 
322 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  39.88 
 
 
330 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.37 
 
 
321 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  39.62 
 
 
769 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  33.44 
 
 
330 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.39 
 
 
321 aa  186  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  37.15 
 
 
321 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.37 
 
 
321 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  39.63 
 
 
326 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  39.34 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.82 
 
 
316 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.77 
 
 
317 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  35.51 
 
 
322 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  39.94 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  36.79 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  38.26 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
321 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.07 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>