More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4341 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  100 
 
 		 379 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  57.61 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  55.89 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  54.25 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  54.25 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  54.25 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  53.7 
 
 		 351 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12789  oxidoreductase  45.24 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.315864  normal  0.803284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  43.08 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  43.08 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  42.69 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  40.49 
 
 		 319 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  43.61 
 
 		 774 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  43.09 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  40.49 
 
 		 315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  41.25 
 
 		 315 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  41.25 
 
 		 315 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  41.25 
 
 		 315 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  39.2 
 
 		 331 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  40.06 
 
 		 788 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  38.82 
 
 		 657 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  41.77 
 
 		 784 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  39.21 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  35.26 
 
 		 780 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  38.18 
 
 		 782 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  38.21 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  36.56 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  36.53 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.46 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  38.61 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  38.61 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  38.22 
 
 		 784 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  38.22 
 
 		 784 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  38.22 
 
 		 784 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  38.22 
 
 		 784 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.51 
 
 		 783 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  38.22 
 
 		 784 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  38.22 
 
 		 784 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  37.9 
 
 		 784 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  35.37 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  37.65 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  37.95 
 
 		 322 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  38.29 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  37.31 
 
 		 783 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  35.05 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  31.58 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  35.95 
 
 		 321 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  36.83 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  36.83 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  35.15 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  38.41 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  35.65 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  34.41 
 
 		 769 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  35.53 
 
 		 322 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  36.22 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  35.37 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  33.23 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  36.59 
 
 		 320 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  37.3 
 
 		 775 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  33.23 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  33.95 
 
 		 788 aa  176  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.84 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  36.05 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  36.39 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  36.28 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  37 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  33.65 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  37.88 
 
 		 754 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  34.58 
 
 		 794 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  37.85 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  33.33 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  35.33 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  35.51 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  35.44 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.78 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  35.22 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  35.65 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  34.49 
 
 		 321 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  35.65 
 
 		 321 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.05 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  36.92 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  34.85 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.35 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.95 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  35.28 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  33.33 
 
 		 588 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  34.91 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  36.88 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  35.02 
 
 		 321 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  34.77 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  35.09 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  35.02 
 
 		 321 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.35 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.65 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  35.44 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  36.13 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>