More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3939 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  100 
 
 		 558 aa  1164    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0581  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  51.94 
 
 		 208 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0577  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.17 
 
 		 208 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0547  FMN-binding pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related protein protein  56.52 
 
 		 193 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  37.5 
 
 		 775 aa  213  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  37.8 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  50.75 
 
 		 208 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0396556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  36.9 
 
 		 330 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.24 
 
 		 207 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3946  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.22 
 
 		 200 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3744  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.45 
 
 		 225 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5149  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50 
 
 		 207 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25828  normal  0.671283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6225  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  48.76 
 
 		 206 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  35.44 
 
 		 788 aa  193  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  36.52 
 
 		 784 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  36.22 
 
 		 309 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  35.21 
 
 		 321 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  36.28 
 
 		 319 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3316  hypothetical protein  51.34 
 
 		 217 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  33.95 
 
 		 323 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  49.01 
 
 		 212 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.83 
 
 		 325 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1189  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.71 
 
 		 213 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.62 
 
 		 321 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  34.76 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  34.76 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  34.76 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  34.76 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  34.76 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0264  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  47 
 
 		 205 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  34.76 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  34.45 
 
 		 784 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  33.84 
 
 		 783 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.35 
 
 		 317 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  33.43 
 
 		 321 aa  180  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  35.31 
 
 		 321 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  35.87 
 
 		 334 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  36.62 
 
 		 327 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  35.58 
 
 		 322 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.94 
 
 		 319 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  35.35 
 
 		 322 aa  178  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  34.64 
 
 		 317 aa  177  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  34.44 
 
 		 316 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  34.44 
 
 		 316 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  35.74 
 
 		 317 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  35.12 
 
 		 324 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  34.44 
 
 		 769 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  35.31 
 
 		 321 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.73 
 
 		 318 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  35.31 
 
 		 321 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3727  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.63 
 
 		 212 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0330635  normal  0.579917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.46 
 
 		 315 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  33.64 
 
 		 320 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  35.28 
 
 		 321 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  48.55 
 
 		 181 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00138595  normal  0.058768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.02 
 
 		 783 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  35.81 
 
 		 321 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  33.02 
 
 		 780 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3650  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.57 
 
 		 209 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  36.14 
 
 		 316 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  33.64 
 
 		 782 aa  173  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  35.08 
 
 		 318 aa  173  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  34.45 
 
 		 323 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.65 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  35.11 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  37.11 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  34.09 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  33.23 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.14 
 
 		 317 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  33.23 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  32.34 
 
 		 794 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  33.13 
 
 		 321 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  33.13 
 
 		 321 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  34.91 
 
 		 316 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  35.31 
 
 		 328 aa  170  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  33.14 
 
 		 323 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  35.98 
 
 		 332 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  33.01 
 
 		 309 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  35.48 
 
 		 323 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.52 
 
 		 331 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.13 
 
 		 321 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  36.28 
 
 		 319 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  32.82 
 
 		 321 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  32.82 
 
 		 321 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  32.14 
 
 		 1070 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  35.74 
 
 		 319 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  34.91 
 
 		 316 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.82 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  34.88 
 
 		 325 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  33.23 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.94 
 
 		 316 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  35.53 
 
 		 318 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  31.76 
 
 		 1069 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  34.38 
 
 		 323 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  34.59 
 
 		 316 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  34.06 
 
 		 322 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  33.44 
 
 		 321 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  35.08 
 
 		 315 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.52 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  35.29 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>