More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4041 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4041  amidase  100 
 
 		 468 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0559  amidase  51.18 
 
 		 468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  48.71 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  49.89 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  36.44 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  35.15 
 
 		 474 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  35.65 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  35 
 
 		 474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  32.12 
 
 		 475 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  37.04 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  33.47 
 
 		 471 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0729  putative amidase  34.61 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.498562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  34.03 
 
 		 469 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.77 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  33.82 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  36.6 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  36.29 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  33.47 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  33.05 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  37.84 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  36.31 
 
 		 509 aa  170  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  36.82 
 
 		 462 aa  170  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  32.71 
 
 		 498 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  34.3 
 
 		 471 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  33.47 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  38.37 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  34.49 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.02 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  35.34 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  32.43 
 
 		 471 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  30.64 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  34.19 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  35.73 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  32.77 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  31.67 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  34.53 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  35.51 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  34.62 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  36 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  34.62 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  32.9 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  37.47 
 
 		 468 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.97 
 
 		 485 aa  163  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  32.77 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  33.89 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  33.61 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.93 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  33.26 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  33.96 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.64 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  35.44 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  34.19 
 
 		 464 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  34.19 
 
 		 464 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  32.34 
 
 		 507 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  29.94 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  32.42 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.12 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3156  amidase  34.44 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  32.23 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  32.71 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  34.11 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  31.6 
 
 		 499 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.21 
 
 		 495 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  29.51 
 
 		 472 aa  153  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  32.29 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  32.23 
 
 		 494 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  29.96 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.84 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  34.41 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  34.74 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.44 
 
 		 494 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  34.41 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  33.33 
 
 		 516 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  33.33 
 
 		 516 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  31.9 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  32.7 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.48 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.22 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  32.77 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  32.29 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  31.33 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  31.21 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.14 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  36.27 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  32.06 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  30.98 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  30.98 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  30.98 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  31.76 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  35.94 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  32.1 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.33 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  34.9 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  33.61 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  32.14 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  34.25 
 
 		 481 aa  147  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.73 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.58 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  32.27 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  33.41 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>