More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0559 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0559  amidase  100 
 
 		 468 aa  927    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4041  amidase  50.11 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  48.82 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  47.06 
 
 		 459 aa  359  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  36.83 
 
 		 461 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.51 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.81 
 
 		 473 aa  222  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  35.26 
 
 		 486 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.26 
 
 		 477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.19 
 
 		 485 aa  210  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  36.1 
 
 		 492 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  33.2 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  32.99 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  32.08 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0729  putative amidase  35.27 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.498562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  30.8 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  34.39 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.97 
 
 		 474 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  36.44 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  32.68 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  33.41 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  36.34 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.44 
 
 		 482 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.92 
 
 		 496 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  32.99 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  35.84 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  34.45 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  34.69 
 
 		 516 aa  189  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  33.05 
 
 		 485 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  33.26 
 
 		 485 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  35.62 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  32.27 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  36.67 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  30.75 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  32.97 
 
 		 507 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  34.69 
 
 		 516 aa  186  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  31.17 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  32.63 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  32.84 
 
 		 485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  36.46 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  36.46 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  35.37 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  33.9 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  30.95 
 
 		 494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.71 
 
 		 483 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  34.18 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.4 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  33.48 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  32.07 
 
 		 494 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  34.9 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  34.59 
 
 		 487 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  34.76 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.4 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  33.9 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  36.25 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  36.25 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  33.19 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  33.26 
 
 		 485 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.77 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  29.88 
 
 		 486 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  31.36 
 
 		 494 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  33.19 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  31.99 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.54 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  35.18 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  31.83 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  31.99 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  31.99 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  35.18 
 
 		 535 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  31.08 
 
 		 466 aa  176  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  31.14 
 
 		 494 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  32.42 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.1 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  34.88 
 
 		 462 aa  176  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  29.21 
 
 		 495 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  34.24 
 
 		 508 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.44 
 
 		 482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.85 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  33.84 
 
 		 477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  33.12 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  33.12 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  33.62 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.26 
 
 		 485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  36.46 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  36.46 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  35.93 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  32.52 
 
 		 469 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  32.39 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.21 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.93 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.8 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  33.93 
 
 		 517 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  25.76 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.63 
 
 		 482 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.24 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  32.76 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.93 
 
 		 496 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  32.48 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.45 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  33.83 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>