More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1905 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1905  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0822251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1818  uracil phosphoribosyltransferase  70.05 
 
 		 209 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0671  uracil phosphoribosyltransferase  65.7 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 		 208 aa  284  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1453  uracil phosphoribosyltransferase  64.73 
 
 		 208 aa  284  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2735  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2645  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0438743  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2693  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2866  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0946  uracil phosphoribosyltransferase  64.73 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0868465  normal  0.525652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2093  uracil phosphoribosyltransferase  62.8 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000398312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2757  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02390  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1171  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.357619  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2645  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.325171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1130  uracil phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 		 212 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.248593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2872  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1178  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0242269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2633  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2544  uracil phosphoribosyltransferase  64.73 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000155874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2781  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3720  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2759  uracil phosphoribosyltransferase  64.73 
 
 		 208 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0969  uracil phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 		 212 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.579048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2379  uracil phosphoribosyltransferase  64.73 
 
 		 208 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  0.622917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2451  uracil phosphoribosyltransferase  64.73 
 
 		 208 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00571838  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2096  uracil phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 		 208 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2548  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000189333  hitchhiker  0.0000000219395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1731  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00552662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1774  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411747  normal  0.785811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1736  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000718639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1597  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000154969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1979  uracil phosphoribosyltransferase  62.8 
 
 		 212 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267185  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1514  uracil phosphoribosyltransferase  62.8 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000447278  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4728  uracil phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202262  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2389  uracil phosphoribosyltransferase  61.35 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1818  uracil phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002782  uracil phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 210 aa  278  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41360  uracil phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 212 aa  277  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03199  uracil phosphoribosyltransferase  61.35 
 
 		 210 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1235  uracil phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0527635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3121  uracil phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1352  uracil phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3186  uracil phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 208 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2743  uracil phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 		 208 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000380844  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4443  uracil phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2576  uracil phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 		 208 aa  275  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0746  uracil phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 212 aa  274  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0774  uracil phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 212 aa  274  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0787  uracil phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 212 aa  274  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785203 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 208 aa  274  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3523  uracil phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 209 aa  274  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00113059  normal  0.884309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1130  uracil phosphoribosyltransferase  61.35 
 
 		 208 aa  274  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61470  uracil phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 		 212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.273036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5295  uracil phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 212 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1846  Uracil phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 208 aa  272  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000894444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2095  uracil phosphoribosyltransferase  63.46 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2991  uracil phosphoribosyltransferase  60.39 
 
 		 208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1078  uracil phosphoribosyltransferase  59.42 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1628  uracil phosphoribosyltransferase  58.94 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.741062  normal  0.0335105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0463  uracil phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 		 209 aa  268  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02630  uracil phosphoribosyltransferase  62.02 
 
 		 209 aa  266  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0480  uracil phosphoribosyltransferase  62.02 
 
 		 209 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000100882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0947  uracil phosphoribosyltransferase  58.94 
 
 		 208 aa  265  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1341  uracil phosphoribosyltransferase  59.42 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.281958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0997  uracil phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1556  uracil phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.394444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  57.97 
 
 		 208 aa  257  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00304  uracil phosphoribosyltransferase  60.39 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0933  uracil phosphoribosyltransferase  64.42 
 
 		 209 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1448  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 		 208 aa  251  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2490  uracil phosphoribosyltransferase  57.97 
 
 		 208 aa  251  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1967  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 215 aa  248  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2263  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 215 aa  248  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.141851  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0911  uracil phosphoribosyltransferase  56.04 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0996  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.688134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1968  uracil phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.657111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  56.65 
 
 		 212 aa  237  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0086  uracil phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 		 209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.91121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  49.01 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  50.5 
 
 		 210 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 370 aa  207  7e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  46.53 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  46.57 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4070  uracil phosphoribosyltransferase  51.71 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>