More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0465 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 220 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  94.55 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  86.41 
 
 		 211 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  83.1 
 
 		 216 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  82.63 
 
 		 216 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  83.1 
 
 		 216 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  72.82 
 
 		 211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  69.9 
 
 		 209 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  71.36 
 
 		 209 aa  307  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  68.45 
 
 		 209 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  68.45 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  67.48 
 
 		 209 aa  296  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  67.96 
 
 		 208 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  67.48 
 
 		 208 aa  295  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  66.5 
 
 		 209 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  66.5 
 
 		 209 aa  292  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  66.5 
 
 		 209 aa  290  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  67.48 
 
 		 208 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  64.56 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  64.35 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  65.53 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  63.59 
 
 		 209 aa  285  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  63.59 
 
 		 209 aa  285  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  64.22 
 
 		 209 aa  284  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  66.5 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  63.21 
 
 		 213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  64.08 
 
 		 209 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  62.62 
 
 		 214 aa  281  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  62.62 
 
 		 214 aa  281  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  64.08 
 
 		 209 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  64.08 
 
 		 209 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  64.08 
 
 		 209 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  63.59 
 
 		 210 aa  277  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  62.75 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  58.22 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  62.62 
 
 		 227 aa  270  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  60.68 
 
 		 210 aa  270  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  61.65 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  62.14 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  59.31 
 
 		 209 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  62.14 
 
 		 210 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  59.22 
 
 		 211 aa  269  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2976  uracil phosphoribosyltransferase  59.91 
 
 		 214 aa  269  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310463  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  61.17 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  57.35 
 
 		 209 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 		 209 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 209 aa  267  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  60.78 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 		 210 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 370 aa  263  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3259  uracil phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 		 211 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  62.62 
 
 		 213 aa  261  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  60.56 
 
 		 216 aa  260  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  56.37 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 208 aa  259  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 209 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2718  uracil phosphoribosyltransferase  59.02 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 207 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 218 aa  255  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  55.34 
 
 		 213 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 208 aa  251  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  54.41 
 
 		 209 aa  251  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 209 aa  248  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 211 aa  245  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 		 209 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 		 209 aa  241  7e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 209 aa  241  7e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  52.48 
 
 		 203 aa  241  7.999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  53.69 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 216 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 216 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 216 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  51.47 
 
 		 207 aa  231  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5620  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  55.34 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 		 211 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>