125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1786 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1786  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  56.19 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  36.36 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  32.46 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  31.71 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  30.7 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  30.7 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  30.7 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  27.23 
 
 		 450 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  34.29 
 
 		 217 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  34.31 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  29.84 
 
 		 232 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  32.26 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.04 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  32.35 
 
 		 476 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.58 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  30.71 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  31.36 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  24.59 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  32.73 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  29.33 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  30.99 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  31.4 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 495 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  31.62 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  33.33 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  29.33 
 
 		 177 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.48 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.29 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  25.4 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  29.29 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  29.55 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  29.17 
 
 		 452 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  26.56 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  27.1 
 
 		 173 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  30.68 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  31 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 173 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  28.29 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  28.29 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  30.5 
 
 		 177 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 446 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  30.63 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  28.29 
 
 		 221 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 346 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  25.93 
 
 		 160 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  32.11 
 
 		 150 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  28.67 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  28 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  26.6 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  31.4 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 575 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  26.09 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  29.57 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  28 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  28 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  28 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  28 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  32.08 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  28.24 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  26.83 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  28.19 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  32.04 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  26.62 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  31.07 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  32.04 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  25.22 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  23.26 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  27.45 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  28.24 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  30.66 
 
 		 167 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  26.83 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2088  cell wall-associated hydrolase  33.33 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.155991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  32.46 
 
 		 532 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  28.24 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.1 
 
 		 413 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  27.64 
 
 		 164 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  31.07 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  32.67 
 
 		 579 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  29.09 
 
 		 181 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 532 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>