More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1768 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
320 aa  645    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  60.46 
 
 
331 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.43 
 
 
327 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.57 
 
 
346 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  58.41 
 
 
341 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  59.87 
 
 
340 aa  360  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  61.18 
 
 
332 aa  358  9e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.19 
 
 
331 aa  352  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.33 
 
 
330 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.55 
 
 
324 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.95 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.8 
 
 
339 aa  326  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.49 
 
 
305 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  50.17 
 
 
313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.44 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.66 
 
 
350 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  50 
 
 
346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
335 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.98 
 
 
329 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  42.06 
 
 
334 aa  261  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
321 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 
319 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
333 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
324 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
308 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
317 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.81 
 
 
331 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
304 aa  228  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
311 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
318 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.8 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
339 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
326 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
334 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
322 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
315 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
307 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
319 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
332 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
312 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
310 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
330 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
313 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.05 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
315 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
318 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
318 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.22 
 
 
336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  34.02 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
327 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
332 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
326 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  32.67 
 
 
316 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
335 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
298 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
315 aa  186  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
324 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
351 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  34.27 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
326 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
324 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
320 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
300 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
326 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
316 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
323 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
316 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
288 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
478 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  28.75 
 
 
322 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  28.85 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.87 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
307 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.8 
 
 
321 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.68 
 
 
333 aa  123  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
316 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
322 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
296 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
315 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27340  permease component of ABC-type sugar transporter  34.65 
 
 
319 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
331 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
324 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000204062  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
316 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  28.19 
 
 
350 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.67 
 
 
294 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5408  carbohydrate ABC transporter membrane protein 1, CUT1 family  30.13 
 
 
305 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
298 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
290 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 
287 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>