More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2192 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.36 
 
 
326 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  42.52 
 
 
324 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
326 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.19 
 
 
323 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  44.63 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
317 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
320 aa  262  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
315 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
332 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
318 aa  257  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
339 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.3 
 
 
331 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.08 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  44.44 
 
 
327 aa  252  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
334 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.85 
 
 
336 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
315 aa  247  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  40.27 
 
 
326 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
326 aa  242  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
332 aa  242  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
340 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
315 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
322 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
298 aa  235  8e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
335 aa  235  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
321 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  40.56 
 
 
334 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
310 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
322 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
313 aa  225  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
304 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
318 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
330 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
324 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
323 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
304 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
319 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
311 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
318 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
308 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
339 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.32 
 
 
331 aa  192  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
320 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
323 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
331 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
312 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
346 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  33.01 
 
 
340 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  32.26 
 
 
341 aa  178  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
315 aa  178  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
310 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.19 
 
 
332 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
327 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  31.61 
 
 
313 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
324 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.98 
 
 
346 aa  168  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
324 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
316 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
305 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
329 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
288 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
335 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
332 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
478 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
316 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
292 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
350 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
319 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 
316 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
333 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  30.82 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
309 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
290 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
316 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.37 
 
 
294 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
306 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.28 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
329 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.86 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>