More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0085 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
318 aa  641    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
313 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.5 
 
 
304 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.32 
 
 
304 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
317 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 
312 aa  297  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
308 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
315 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.06 
 
 
323 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
321 aa  279  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.65 
 
 
330 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
311 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.33 
 
 
315 aa  266  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  44.01 
 
 
331 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 
315 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
323 aa  258  8e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
318 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  42.05 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
324 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
298 aa  249  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
333 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  43.33 
 
 
324 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 
322 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 
310 aa  242  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
325 aa  241  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  42.03 
 
 
326 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 
327 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.74 
 
 
334 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
351 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
328 aa  232  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
334 aa  232  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
332 aa  231  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
326 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
315 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
322 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
326 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
318 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
332 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.75 
 
 
336 aa  225  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  40.14 
 
 
324 aa  225  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  43.38 
 
 
327 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
307 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
310 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
320 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
346 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
323 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
326 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
320 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
350 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
339 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
305 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
331 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
292 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.32 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  35.81 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.28 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
327 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
478 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
324 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
324 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  33.76 
 
 
341 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.46 
 
 
332 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
313 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
288 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
319 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  36.07 
 
 
308 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
329 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
332 aa  182  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.42 
 
 
346 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
321 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
307 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
333 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
296 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000204062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.7 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
309 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
308 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123951  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01490  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.47 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
319 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0200859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>