More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0860 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
318 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.82 
 
 
304 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.12 
 
 
304 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
308 aa  263  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
315 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
312 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
323 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
319 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.9 
 
 
333 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
330 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 
324 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
322 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
311 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
318 aa  245  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.66 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  40.94 
 
 
324 aa  242  7e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.35 
 
 
316 aa  239  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
339 aa  238  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
323 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.95 
 
 
324 aa  235  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
315 aa  235  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
298 aa  233  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
332 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
320 aa  231  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  38.34 
 
 
334 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
340 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.1 
 
 
326 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
332 aa  229  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
322 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
326 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
334 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
328 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
307 aa  225  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.5 
 
 
336 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
335 aa  221  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
326 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.27 
 
 
327 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
310 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
326 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
330 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
323 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.67 
 
 
313 aa  198  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
316 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
320 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
320 aa  192  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
339 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
478 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
316 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
331 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
326 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  33.12 
 
 
340 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  32.88 
 
 
341 aa  185  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.56 
 
 
331 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
327 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
350 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
292 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.92 
 
 
332 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
324 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
322 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  34.21 
 
 
346 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  35.84 
 
 
308 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
321 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
288 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
329 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
333 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
307 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 
309 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  28.25 
 
 
350 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
338 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
299 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
311 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
326 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
317 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
324 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000204062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27340  permease component of ABC-type sugar transporter  30.94 
 
 
319 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
322 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
326 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
300 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>