More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0339 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
333 aa  681    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
321 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.36 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.76 
 
 
325 aa  328  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  52.74 
 
 
334 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.64 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.92 
 
 
323 aa  268  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.58 
 
 
331 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
332 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
315 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
330 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.56 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  42.91 
 
 
324 aa  266  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
310 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 
330 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
322 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  45.54 
 
 
331 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.14 
 
 
318 aa  261  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
326 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
304 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
334 aa  258  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
328 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.52 
 
 
304 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
313 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
322 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
317 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
331 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
324 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  40.48 
 
 
340 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
319 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
324 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
305 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 
318 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
327 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  40.82 
 
 
341 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  40.72 
 
 
336 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.89 
 
 
324 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
326 aa  242  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
298 aa  241  9e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
339 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
315 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
312 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.32 
 
 
327 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
308 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.63 
 
 
319 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
315 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
320 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
320 aa  235  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47 
 
 
329 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
326 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  43.23 
 
 
346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
310 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
320 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.46 
 
 
313 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
335 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
332 aa  229  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.23 
 
 
332 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
323 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.11 
 
 
332 aa  225  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
335 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  38.26 
 
 
316 aa  222  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
326 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
327 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
351 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
316 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
324 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
288 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
316 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
333 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
292 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
478 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  30.77 
 
 
308 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
307 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.36 
 
 
309 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.417375  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
317 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.8 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.94 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.05 
 
 
293 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.52 
 
 
317 aa  106  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.76 
 
 
316 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
300 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.89 
 
 
310 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.62 
 
 
291 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>