More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1438 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
335 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.25 
 
 
332 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  57.86 
 
 
331 aa  343  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.55 
 
 
330 aa  343  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.49 
 
 
327 aa  342  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.51 
 
 
331 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.14 
 
 
346 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  56.76 
 
 
341 aa  331  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  54.6 
 
 
340 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.19 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  55.7 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
320 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  52.29 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.9 
 
 
305 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.4 
 
 
339 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  52.87 
 
 
346 aa  295  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.28 
 
 
310 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.33 
 
 
321 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.51 
 
 
350 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.82 
 
 
333 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 
319 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.19 
 
 
329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  45.78 
 
 
334 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.71 
 
 
324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
325 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
332 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
311 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
304 aa  231  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.72 
 
 
326 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
334 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
304 aa  225  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
317 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
323 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
308 aa  222  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
318 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
315 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
319 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
315 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
322 aa  212  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
328 aa  212  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
318 aa  209  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.93 
 
 
324 aa  208  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
312 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
310 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.63 
 
 
336 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
318 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
315 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.69 
 
 
316 aa  202  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
298 aa  199  7e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
340 aa  195  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
323 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
320 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
315 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
335 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
326 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
307 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
324 aa  188  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.72 
 
 
327 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
326 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  34.39 
 
 
324 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
326 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
330 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
320 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
324 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
326 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
351 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
316 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
323 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
478 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
292 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
288 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  30.36 
 
 
308 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 
322 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
333 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
321 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
313 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
309 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5408  carbohydrate ABC transporter membrane protein 1, CUT1 family  28.88 
 
 
305 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  27.68 
 
 
350 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
315 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
319 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.255158 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
296 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
317 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1114  sugar ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 
301 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 
288 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.042733  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
289 aa  95.9  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>