More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1114 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1114  sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 
301 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1059  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  39 
 
 
310 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824779  normal  0.0156091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
309 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
306 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
292 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153616  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
319 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
317 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.156333  normal  0.563407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
293 aa  175  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.049937  normal  0.069127 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
287 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484603  normal  0.727796 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
295 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
309 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
299 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
320 aa  165  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.67 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
320 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.66 
 
 
313 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.68002  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
328 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
315 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
298 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.71 
 
 
310 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
292 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
299 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
309 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
330 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
299 aa  158  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  34.28 
 
 
315 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  33.68 
 
 
311 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0810  ABC-type sugar transport system, permease component  35.06 
 
 
283 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
310 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
316 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
299 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
294 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
313 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
294 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
306 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.56 
 
 
354 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
296 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
293 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  31.29 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
306 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  30.58 
 
 
307 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
307 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
287 aa  152  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
288 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
311 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
318 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
294 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
294 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.77 
 
 
317 aa  151  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
315 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  30.58 
 
 
294 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.75 
 
 
305 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.8 
 
 
308 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
345 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
316 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
297 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
295 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.1 
 
 
314 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
296 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  36.1 
 
 
314 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
291 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.18 
 
 
310 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
311 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
297 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4890  sugar transport system (permease)  31.2 
 
 
284 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  30.43 
 
 
321 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
332 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
292 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
299 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
309 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  30.93 
 
 
318 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
312 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  32.78 
 
 
312 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
306 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
318 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
313 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
309 aa  148  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.62 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1051  lactose transport system permease protein  32.46 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390377  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1486  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.81 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0456684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.159905  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
299 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
315 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
320 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
311 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
296 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
330 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
316 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
291 aa  146  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>