More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3533 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
319 aa  634    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.255158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.44 
 
 
313 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.68002  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
290 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
319 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
294 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
296 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000144721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
328 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1486  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.74 
 
 
309 aa  162  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0456684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
288 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
309 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
319 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
309 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
305 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.86 
 
 
287 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
315 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
288 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
294 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0810  ABC-type sugar transport system, permease component  33.84 
 
 
283 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
320 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
296 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
299 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
332 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
318 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
292 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
322 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
314 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6934  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.04 
 
 
289 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
321 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
309 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
299 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.11 
 
 
320 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  31.6 
 
 
307 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
307 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
330 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
310 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
307 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
305 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.63 
 
 
320 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
296 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
316 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
291 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
310 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
300 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
296 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.648492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
305 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.661532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
308 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.9 
 
 
354 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
338 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 
308 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 
308 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
316 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  32.79 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32 
 
 
275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.44 
 
 
301 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
297 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
307 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
313 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
321 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
317 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
300 aa  146  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
300 aa  146  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
297 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  30.74 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
312 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
313 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
292 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824779  normal  0.0156091 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
305 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
293 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
293 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
300 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
309 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.049937  normal  0.069127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
310 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
338 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.335951  normal  0.466485 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.68 
 
 
319 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
318 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
319 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
313 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3105  ABC transporter, permease component  36 
 
 
294 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.04 
 
 
317 aa  143  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
309 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
312 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
312 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772545  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
324 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
326 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4890  sugar transport system (permease)  32.7 
 
 
284 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1114  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
301 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  0.915782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>