More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2732 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
316 aa  641    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
321 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
310 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
315 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
318 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  38.61 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
315 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
333 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
304 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
308 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
322 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
300 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
325 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
323 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
324 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
313 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
330 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
339 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.71 
 
 
331 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
320 aa  188  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.29 
 
 
324 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
351 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
319 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
311 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
340 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
312 aa  185  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.93 
 
 
326 aa  185  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
315 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.06 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
328 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
322 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
326 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
332 aa  179  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
327 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
324 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
335 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35 
 
 
324 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  34.58 
 
 
327 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
288 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
346 aa  165  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  32.36 
 
 
316 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
327 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
339 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
478 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
333 aa  155  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
310 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  31.99 
 
 
341 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  32.17 
 
 
340 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
350 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
316 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
332 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
307 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
292 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
331 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  33.56 
 
 
331 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
319 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  31.55 
 
 
313 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
321 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
316 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  31.75 
 
 
346 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
305 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  31.41 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 
322 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  30.79 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.76 
 
 
291 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3074  sugar ABC transporter permease protein  28.53 
 
 
307 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  27.65 
 
 
321 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.57 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  26.54 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  26.57 
 
 
294 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 
308 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 
308 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  27.07 
 
 
294 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
294 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>