More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3315 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
324 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88 
 
 
325 aa  557  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.82 
 
 
321 aa  360  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  51.08 
 
 
334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.36 
 
 
333 aa  335  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
317 aa  272  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
330 aa  262  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  42.77 
 
 
331 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
323 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 
304 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
332 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.2 
 
 
328 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
339 aa  258  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
315 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
318 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
318 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  43.4 
 
 
326 aa  252  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
326 aa  252  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
330 aa  252  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
311 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.97 
 
 
322 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.55 
 
 
346 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.94 
 
 
304 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  43.45 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
308 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
315 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  45.48 
 
 
336 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.14 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.39 
 
 
305 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
298 aa  237  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
329 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  45.76 
 
 
346 aa  235  7e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
313 aa  235  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
312 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
315 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.72 
 
 
332 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
319 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.32 
 
 
324 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
327 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.12 
 
 
316 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 
310 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 
332 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
324 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
310 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
339 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  37.66 
 
 
324 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  43.49 
 
 
331 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  41.59 
 
 
340 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.94 
 
 
331 aa  225  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
307 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
335 aa  221  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
327 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  40.13 
 
 
313 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  40.52 
 
 
332 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  38.56 
 
 
341 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
326 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.58 
 
 
335 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
300 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
316 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
324 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
351 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
323 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
478 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
288 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  35.71 
 
 
308 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
333 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
313 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
316 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
321 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
307 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.5 
 
 
294 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
311 aa  106  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
315 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
290 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
309 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
309 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
316 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
289 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
317 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
316 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
302 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.159905  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>