More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1814 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
329 aa  660    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.38 
 
 
328 aa  394  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.79 
 
 
348 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57 
 
 
321 aa  343  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.824924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
295 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.05 
 
 
349 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.05 
 
 
349 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
323 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
307 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
309 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.82 
 
 
289 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
290 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.91 
 
 
302 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  35.91 
 
 
302 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.57 
 
 
302 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  36.04 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  36.04 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
302 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
302 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
302 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  36.23 
 
 
299 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
302 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
294 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
335 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
294 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
306 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
275 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
317 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
317 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
317 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
317 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
293 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
319 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
308 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
302 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
294 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
313 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
290 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
289 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.97 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
309 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
312 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
298 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  30.52 
 
 
312 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.93 
 
 
312 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968646  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
291 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  30.29 
 
 
318 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
313 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
321 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
305 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  31.53 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.38 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  29.77 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
334 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
323 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.939574  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.34 
 
 
300 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  29.35 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.84 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
321 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
350 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344745  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  29.35 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
288 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  29.35 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  29.45 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  29.35 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  29.35 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  30.11 
 
 
300 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  28.74 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.96 
 
 
301 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
309 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
292 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  30.86 
 
 
315 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
307 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 
307 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
299 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
302 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>