More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4350 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
309 aa  630  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  68.18 
 
 
310 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  68.18 
 
 
310 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  65.37 
 
 
302 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  65.37 
 
 
302 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.36 
 
 
302 aa  417  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.64 
 
 
302 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.29 
 
 
302 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.75 
 
 
302 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.64 
 
 
302 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.6 
 
 
302 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  65.1 
 
 
299 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.99 
 
 
309 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.16 
 
 
293 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.22 
 
 
295 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.01 
 
 
294 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.54 
 
 
302 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  58.06 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  57.74 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.06 
 
 
312 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.06 
 
 
312 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  58.06 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  58.06 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  58.06 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  58.06 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  58.06 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.35 
 
 
289 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.42 
 
 
312 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.13 
 
 
292 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  57.7 
 
 
357 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.66 
 
 
313 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
292 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
293 aa  360  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  56.17 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968646  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.42 
 
 
292 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  60.93 
 
 
349 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  60.93 
 
 
349 aa  359  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.52 
 
 
312 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.62 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.62 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.13 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.16 
 
 
317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.16 
 
 
317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.42 
 
 
290 aa  348  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.94 
 
 
298 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.07 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.71 
 
 
319 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.71 
 
 
319 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.55 
 
 
288 aa  309  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.84 
 
 
318 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.75 
 
 
314 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2082  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  45.51 
 
 
313 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.785308  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.64 
 
 
304 aa  285  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.72 
 
 
298 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0514652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
301 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.41 
 
 
300 aa  272  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
301 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
302 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
305 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
302 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9199  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.85 
 
 
290 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
295 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.39 
 
 
295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.88 
 
 
295 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101772  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
306 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
323 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
330 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
330 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
307 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  36.9 
 
 
295 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
298 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
298 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
302 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
321 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.824924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
329 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.56 
 
 
300 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
328 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
299 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
290 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
291 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
333 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
318 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
313 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.59 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
313 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115668  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  29.68 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
305 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>