More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0841 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
312 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.29 
 
 
292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  97.95 
 
 
312 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.95 
 
 
312 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.95 
 
 
312 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.6 
 
 
292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  94.18 
 
 
357 aa  567  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  93.15 
 
 
312 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  93.15 
 
 
312 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  93.15 
 
 
312 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  93.15 
 
 
312 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  93.15 
 
 
312 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  92.81 
 
 
312 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.7 
 
 
313 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  86.3 
 
 
312 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968646  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.3 
 
 
312 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.46 
 
 
295 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  63.03 
 
 
310 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  63.03 
 
 
310 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.54 
 
 
302 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  62.11 
 
 
302 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.75 
 
 
302 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.54 
 
 
302 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.65 
 
 
302 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.84 
 
 
302 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.84 
 
 
302 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.81 
 
 
302 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.79 
 
 
292 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  59.86 
 
 
299 aa  363  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.43 
 
 
293 aa  361  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
309 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  60.43 
 
 
349 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.44 
 
 
309 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  60.43 
 
 
349 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.65 
 
 
289 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.74 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.45 
 
 
302 aa  350  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.72 
 
 
294 aa  348  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.94 
 
 
317 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.59 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.94 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.59 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.11 
 
 
298 aa  334  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.44 
 
 
290 aa  315  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.12 
 
 
309 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.12 
 
 
319 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.12 
 
 
319 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
314 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
318 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2082  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.785308  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
304 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
301 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 
301 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
305 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 
298 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0514652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.25 
 
 
295 aa  237  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
302 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.68 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
302 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9199  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.75 
 
 
290 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
335 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
323 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
330 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
295 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101772  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
330 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
295 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
323 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
306 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  35.62 
 
 
295 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
298 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
374 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
294 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
333 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
298 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
299 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
290 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
299 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.9 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.18 
 
 
317 aa  139  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.824924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  32.82 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
330 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
348 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
329 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
306 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
299 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.96 
 
 
354 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>