More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3493 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
298 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.64 
 
 
298 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.48 
 
 
298 aa  362  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  57.05 
 
 
295 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  57.58 
 
 
300 aa  335  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
330 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.1 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
323 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
323 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
307 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
309 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
309 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
302 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
293 aa  185  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.68 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
294 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
317 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
317 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
292 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  36.03 
 
 
302 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
302 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
293 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  36 
 
 
310 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  36 
 
 
310 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.68 
 
 
302 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.35 
 
 
302 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
302 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
302 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.72 
 
 
349 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 
349 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
302 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  34.84 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  34.58 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.25 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968646  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  35.33 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  35.33 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  35.33 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  35.33 
 
 
312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  35.33 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  35.33 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
309 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
312 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
314 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
292 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.92 
 
 
312 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2082  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 
313 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.785308  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
292 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
333 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
312 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
312 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
318 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
292 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
288 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
298 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0514652  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9199  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.8 
 
 
290 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
304 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.72 
 
 
374 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
328 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.48 
 
 
374 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.27 
 
 
300 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
294 aa  136  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
329 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.43 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.824924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
301 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
302 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
295 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101772  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
302 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
292 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
305 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3658  glucose transport system permease protein  47.69 
 
 
372 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0786  ABC transporter membrane spanning protein  30.33 
 
 
343 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000851926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.275951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  30.39 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7165  ABC alpha-glucoside transporter inner membrane binding protein  29.39 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0234886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
309 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
318 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
323 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.939574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>