More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5436 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
318 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2082  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  83.33 
 
 
313 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.785308  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.87 
 
 
314 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.66 
 
 
298 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0514652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.53 
 
 
304 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.23 
 
 
295 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101772  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.49 
 
 
302 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  49.32 
 
 
300 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.31 
 
 
295 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.84 
 
 
309 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.68 
 
 
309 aa  287  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.44 
 
 
301 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9199  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  50 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.44 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.76 
 
 
301 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 
302 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  49.27 
 
 
299 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.56 
 
 
302 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.33 
 
 
295 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.23 
 
 
302 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  44.82 
 
 
302 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
317 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
317 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.58 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.49 
 
 
313 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.3 
 
 
317 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.52 
 
 
317 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  43.42 
 
 
310 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
302 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
302 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
312 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
302 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.57 
 
 
302 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
292 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
294 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  43.56 
 
 
310 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
293 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  45.05 
 
 
312 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  45.05 
 
 
312 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  45.05 
 
 
312 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  45.05 
 
 
312 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  45.05 
 
 
312 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 
292 aa  255  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  45.05 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  44.37 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
312 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
312 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
298 aa  251  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
292 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.94 
 
 
302 aa  248  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
293 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  40.54 
 
 
349 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 
349 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43 
 
 
312 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968646  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.82 
 
 
289 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
319 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
319 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
309 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
288 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
295 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
330 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
330 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  32.77 
 
 
295 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
307 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
298 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
298 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
294 aa  139  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
309 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
318 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
318 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
312 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
316 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
310 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
305 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
299 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
332 aa  132  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.2 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.91 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.79 
 
 
300 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 
319 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
305 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
345 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>