141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2516 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  100 
 
 
370 aa  742    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  68.99 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  48.87 
 
 
388 aa  331  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  49.24 
 
 
388 aa  322  5e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  46.89 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  47.51 
 
 
431 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.94 
 
 
325 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.53 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.86 
 
 
367 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.65 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  33.04 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  27.41 
 
 
333 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.56 
 
 
367 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.59 
 
 
366 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  29.97 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.86 
 
 
334 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.15 
 
 
325 aa  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  27.36 
 
 
334 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  26.04 
 
 
336 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.23 
 
 
359 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  28.57 
 
 
330 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.19 
 
 
386 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  29.91 
 
 
332 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  28.44 
 
 
327 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.04 
 
 
344 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  28.22 
 
 
338 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  26.95 
 
 
334 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  28.44 
 
 
338 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  27.74 
 
 
330 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  28.18 
 
 
348 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  27.91 
 
 
338 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  28.13 
 
 
327 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.13 
 
 
327 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.68 
 
 
340 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  28.13 
 
 
327 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  28.13 
 
 
327 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  28.13 
 
 
327 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  28.13 
 
 
327 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  28.13 
 
 
327 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  28.05 
 
 
327 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  29.85 
 
 
332 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  28.13 
 
 
327 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  28.44 
 
 
327 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  28.44 
 
 
327 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  28.27 
 
 
327 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  28.44 
 
 
327 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  28.44 
 
 
327 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  27.61 
 
 
330 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  28.18 
 
 
358 aa  99.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  26.35 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  28.13 
 
 
327 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.67 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.71 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.51 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  28.27 
 
 
327 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.76 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.8 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.38 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  29.08 
 
 
335 aa  90.1  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.85 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  30.25 
 
 
326 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  25.39 
 
 
328 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.94 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  29.18 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.63 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  29.18 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.19 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.76 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  30.77 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  24.14 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.76 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3813  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
350 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  hitchhiker  0.00422068 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  22.14 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.15 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 
347 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  22.61 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.81 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 
354 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
341 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  20.85 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  23.23 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.71 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909966  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 
337 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  19.28 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4354  putative ABC transport system, substrate-binding exported protein  21.8 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  22.67 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 
350 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  21.25 
 
 
350 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 
344 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.27 
 
 
334 aa  46.2  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.51 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>