More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1526 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 		 334 aa  681    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  49.4 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  50.32 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  51.51 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  51.2 
 
 		 334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  51.2 
 
 		 334 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  42.36 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  43.08 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  42.22 
 
 		 365 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  42.22 
 
 		 365 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  43.99 
 
 		 337 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  41.37 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  42.63 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  44.27 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  43.45 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  41.21 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  41.21 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  42.2 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  40.54 
 
 		 340 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  39.16 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  42.04 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  40.18 
 
 		 347 aa  258  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  42.09 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  43.89 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 347 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 339 aa  255  8e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  42.22 
 
 		 349 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  42.09 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  41.03 
 
 		 337 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 		 336 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.81 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  40.12 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  41.62 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  38.41 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  39.31 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  39.51 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  40.77 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  39.94 
 
 		 347 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  39.51 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  40.48 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  39.52 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  42.3 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  40.84 
 
 		 335 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  40.19 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  40.12 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  41.43 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 349 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  40.54 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  36.09 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  40.36 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  38.92 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  39.21 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  38.15 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  38.54 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  37.43 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  38.86 
 
 		 338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  39.51 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 355 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  37.94 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  38.08 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 338 aa  222  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  35.24 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  35.6 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.26 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  38.42 
 
 		 345 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  37.69 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.59 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  35.29 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  36.5 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.78 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  36.02 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.54 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  36.5 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>