93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0388 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  100 
 
 		 388 aa  788    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  64.27 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  48.98 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  48.85 
 
 		 370 aa  333  4e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  50.15 
 
 		 431 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  37.83 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  29.27 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.36 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.97 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.21 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  29.85 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  28.84 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  27.41 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  28.18 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  29.54 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  27.52 
 
 		 330 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  28.26 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  29.02 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  28.08 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.74 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.21 
 
 		 334 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  28 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  27.64 
 
 		 358 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  27.96 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  28.75 
 
 		 328 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  28.39 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  28.39 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  28.39 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.9 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  28.39 
 
 		 327 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  27.9 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.34 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  27.9 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  27.9 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  28.08 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  27.1 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  27.1 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  27.1 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  27.1 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  27.1 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  27.88 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.44 
 
 		 361 aa  106  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  26.61 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  26.32 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  27.95 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.26 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  31.03 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  29.62 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  26.69 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.77 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.36 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.78 
 
 		 357 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.78 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  30.22 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  30.22 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.55 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  26.02 
 
 		 334 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  25.71 
 
 		 334 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.36 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.86 
 
 		 343 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.8 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  23.74 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.37 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.48 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.71 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  25 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  24 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.67 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3813  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  hitchhiker  0.00422068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.71 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.71 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  24.12 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  24.12 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  24.12 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.12 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.11 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  24.12 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.32 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.71 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.2 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25.25 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1789  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>