144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1142 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  100 
 
 
334 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  86.23 
 
 
334 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  85.93 
 
 
334 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  63.77 
 
 
342 aa  457  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  67.2 
 
 
333 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  65.61 
 
 
332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  58.38 
 
 
338 aa  401  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  57.58 
 
 
338 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  57.88 
 
 
328 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  58.01 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  58.01 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  58.01 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  58.01 
 
 
327 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  58.33 
 
 
327 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  58.33 
 
 
327 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  58.33 
 
 
327 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  57.56 
 
 
327 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  57.79 
 
 
327 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  57.37 
 
 
327 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  57.37 
 
 
327 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  57.37 
 
 
327 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  58.47 
 
 
327 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  57.79 
 
 
327 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  57.79 
 
 
327 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  58.15 
 
 
327 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  57.47 
 
 
327 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  53.33 
 
 
348 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  53.33 
 
 
358 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  52.58 
 
 
330 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  53.21 
 
 
332 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  54.24 
 
 
330 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  53.05 
 
 
330 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  53.8 
 
 
338 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  53.25 
 
 
337 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  50.3 
 
 
326 aa  325  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  47.53 
 
 
334 aa  317  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  50.65 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  50.32 
 
 
327 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  50 
 
 
342 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  50.65 
 
 
327 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  41.23 
 
 
338 aa  266  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  38.08 
 
 
336 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  35.37 
 
 
325 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  37.46 
 
 
325 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  35.41 
 
 
325 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.06 
 
 
361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.77 
 
 
360 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.77 
 
 
357 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.66 
 
 
367 aa  125  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.4 
 
 
344 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.3 
 
 
386 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.64 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.52 
 
 
431 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.66 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.97 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.95 
 
 
370 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.75 
 
 
340 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.88 
 
 
353 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.84 
 
 
366 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.66 
 
 
388 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.43 
 
 
351 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.71 
 
 
387 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.32 
 
 
392 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.27 
 
 
367 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.13 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.35 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.73 
 
 
383 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.9 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  24.83 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.48 
 
 
338 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.08 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.52 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.41 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.41 
 
 
338 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.48 
 
 
334 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.11 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  21.11 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  22.87 
 
 
363 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  21.74 
 
 
362 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1900  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.95 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1758  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  23.95 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0220155  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.27 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2212  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  23.95 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0584  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  23.95 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0487  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  23.95 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0896  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  23.95 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.27 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2099  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.603993  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0855  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.95 
 
 
336 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  21.74 
 
 
363 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  21.74 
 
 
363 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5065  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  22.56 
 
 
365 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0972381  normal  0.728899 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>