163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1200 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 
334 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  52.74 
 
 
330 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  52.45 
 
 
330 aa  358  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  49.85 
 
 
330 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  51.62 
 
 
338 aa  340  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  49.84 
 
 
333 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  48.65 
 
 
348 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  48.65 
 
 
358 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  51.92 
 
 
327 aa  338  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  50.81 
 
 
327 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  50.81 
 
 
327 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  50.81 
 
 
327 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  48.33 
 
 
338 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  51.29 
 
 
327 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  51.46 
 
 
327 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  51.46 
 
 
327 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  51.46 
 
 
327 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  51.46 
 
 
327 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  47.75 
 
 
332 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  50.49 
 
 
327 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  47.06 
 
 
338 aa  332  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  50.16 
 
 
327 aa  332  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  50.16 
 
 
327 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  50.49 
 
 
328 aa  331  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  50.16 
 
 
327 aa  331  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  50.16 
 
 
327 aa  331  9e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  50.49 
 
 
327 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  49.84 
 
 
327 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  51.27 
 
 
332 aa  328  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  50.31 
 
 
334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  50.64 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  50 
 
 
342 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  50 
 
 
334 aa  322  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  47.53 
 
 
334 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  45.35 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  49.07 
 
 
326 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  48.54 
 
 
335 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  49.37 
 
 
327 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  48.87 
 
 
342 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  48.87 
 
 
327 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  41.72 
 
 
338 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  40.55 
 
 
336 aa  215  8e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  36.27 
 
 
325 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  35.37 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.01 
 
 
325 aa  165  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.23 
 
 
367 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.08 
 
 
361 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.29 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.38 
 
 
370 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.14 
 
 
383 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.96 
 
 
388 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.63 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.55 
 
 
363 aa  109  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.28 
 
 
366 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.73 
 
 
431 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.22 
 
 
386 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.81 
 
 
355 aa  106  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.28 
 
 
343 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.05 
 
 
388 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.3 
 
 
357 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.45 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.79 
 
 
344 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.38 
 
 
359 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.99 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.17 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.62 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.23 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  23.65 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.97 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.9 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.58 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.19 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  23.79 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  21.75 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  23.79 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.79 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  23.79 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.39 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.79 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  23.39 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.11 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0855  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.19 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1900  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.19 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1758  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  24.19 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0220155  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2212  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  24.19 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0487  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  24.19 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0896  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  24.19 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0584  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  24.19 
 
 
360 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 
337 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  21.33 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  20.94 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  22.85 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>