103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2798 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  100 
 
 		 327 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  86.54 
 
 		 327 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  85.93 
 
 		 342 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  70.34 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  65.94 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  54.98 
 
 		 330 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  53.27 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  55.48 
 
 		 328 aa  352  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  55.81 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  56.13 
 
 		 327 aa  352  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  51.96 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  51.96 
 
 		 358 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 		 327 aa  350  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  55.16 
 
 		 327 aa  348  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  55.16 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  55.16 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  55.48 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  55.48 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  55.48 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  55.48 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  55.16 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  53.77 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 		 327 aa  345  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  55.34 
 
 		 327 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  51.38 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  51.66 
 
 		 342 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  51.75 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  48.93 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  52.12 
 
 		 338 aa  328  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  53.16 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  50.65 
 
 		 334 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  48.89 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  48.57 
 
 		 334 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  49.37 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  45.71 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  40.56 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  35.46 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.05 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.77 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  34.25 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.67 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.22 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.91 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.14 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.68 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.75 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.1 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.15 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.14 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.63 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.82 
 
 		 367 aa  99.4  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.79 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.17 
 
 		 386 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.93 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29 
 
 		 431 aa  96.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.95 
 
 		 392 aa  97.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.73 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.8 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.49 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.51 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.75 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.52 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.88 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.33 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  36.36 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.35 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.07 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.52 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  23.32 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 350 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  28.92 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  34.21 
 
 		 332 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  26.72 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  27.12 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  26.89 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  26.25 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  23.19 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>