171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3472 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 
337 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  60.31 
 
 
338 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  59.2 
 
 
330 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  60.82 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  59.75 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  57.62 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  58.13 
 
 
338 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  54.9 
 
 
358 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  54.9 
 
 
348 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  59.28 
 
 
338 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  55.84 
 
 
327 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  56.15 
 
 
328 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  56.23 
 
 
327 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  55.59 
 
 
327 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  56.15 
 
 
327 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  56.15 
 
 
327 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  57.47 
 
 
327 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  57.47 
 
 
327 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  57.47 
 
 
327 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  57.47 
 
 
327 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  57.14 
 
 
327 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  56.15 
 
 
327 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  55.84 
 
 
327 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  55.84 
 
 
327 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  55.21 
 
 
327 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  55.84 
 
 
327 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  55.84 
 
 
327 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  55.21 
 
 
327 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  53.25 
 
 
334 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  50.9 
 
 
342 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  52.5 
 
 
334 aa  362  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  52.77 
 
 
333 aa  358  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  51.88 
 
 
334 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  49.68 
 
 
332 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  45.35 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  47.45 
 
 
326 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  47.74 
 
 
327 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  41.87 
 
 
335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  47.42 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  43.28 
 
 
338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  45.71 
 
 
327 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  35.05 
 
 
325 aa  192  7e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  37.17 
 
 
336 aa  192  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.47 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.78 
 
 
325 aa  180  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.75 
 
 
361 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  31.83 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.95 
 
 
367 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.87 
 
 
388 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.1 
 
 
366 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  34.54 
 
 
357 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.93 
 
 
344 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.07 
 
 
386 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  24.85 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.3 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.15 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.84 
 
 
431 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.38 
 
 
370 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  24.84 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.52 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.67 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.17 
 
 
383 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  24.32 
 
 
392 aa  86.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.26 
 
 
386 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  23.1 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.38 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.36 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.19 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  21.74 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  23.53 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.44 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.19 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.2 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.88 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  25.43 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5065  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.98 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0972381  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.85 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  25.68 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  23.86 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  23.86 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  26.03 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.68 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.68 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  25.68 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 
348 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  23.53 
 
 
341 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.53 
 
 
341 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2124  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
400 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
347 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>