140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0615 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  100 
 
 
327 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  91.69 
 
 
327 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  91.69 
 
 
327 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  91.69 
 
 
327 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  91.37 
 
 
327 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  91.37 
 
 
327 aa  599  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  91.05 
 
 
327 aa  597  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  91.37 
 
 
327 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  91.37 
 
 
327 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  92.23 
 
 
327 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  91.05 
 
 
327 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  92.23 
 
 
327 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  92.23 
 
 
327 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  91.91 
 
 
327 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  91.91 
 
 
327 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  79.68 
 
 
328 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  77.32 
 
 
327 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  77.32 
 
 
327 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  71.56 
 
 
338 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  71.87 
 
 
338 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  73.46 
 
 
348 aa  494  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  73.79 
 
 
358 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  66.99 
 
 
330 aa  447  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  62.5 
 
 
332 aa  441  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  61.7 
 
 
330 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  64.59 
 
 
338 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  59.88 
 
 
330 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  58.77 
 
 
333 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  58.23 
 
 
332 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  58.01 
 
 
334 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  58.33 
 
 
334 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  57.05 
 
 
342 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  57.69 
 
 
334 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  55.21 
 
 
337 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  54.52 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  48.35 
 
 
334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  55.81 
 
 
327 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  53.23 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  50.62 
 
 
335 aa  325  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  46.45 
 
 
338 aa  285  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  35.6 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  35.08 
 
 
336 aa  199  7e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.54 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.24 
 
 
325 aa  179  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.38 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.31 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.17 
 
 
367 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.4 
 
 
431 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.54 
 
 
343 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.1 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.1 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.71 
 
 
359 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.89 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.66 
 
 
388 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.74 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.69 
 
 
392 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.85 
 
 
357 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.71 
 
 
340 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.69 
 
 
388 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.44 
 
 
370 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.62 
 
 
367 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25 
 
 
351 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.83 
 
 
383 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.85 
 
 
387 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.38 
 
 
386 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  26 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.86 
 
 
355 aa  89  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  25 
 
 
338 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.33 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  24 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.91 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  22.53 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  22.79 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.79 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.79 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3423  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  22.11 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.074131  normal  0.0682779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  22.97 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.48 
 
 
334 aa  53.5  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.46 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  22.59 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.37 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5065  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  25.41 
 
 
365 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0972381  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
372 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  25.48 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1875  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.39 
 
 
363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217985  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  27.43 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  27.08 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4789  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  27.39 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333603  hitchhiker  0.0000239278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  21.88 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>