More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0732 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 337 aa  700    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  71.6 
 
 		 349 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  60.57 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  60.25 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  60.67 
 
 		 326 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  60.25 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  63.11 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  59.94 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  58.18 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  58.77 
 
 		 339 aa  414  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  56.84 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  58.04 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  57.1 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  56.23 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  55.91 
 
 		 333 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  56.33 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  53.52 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  55.7 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  55.76 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  47.63 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  46.03 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  44.64 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  44.87 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  44.87 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  45.14 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 		 341 aa  285  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  44.62 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  45.54 
 
 		 353 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  42.86 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  44.3 
 
 		 350 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  42.73 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 351 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  43.63 
 
 		 355 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  44.65 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 		 347 aa  272  7e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  45.05 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  42.15 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  41.54 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  40.36 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  41.64 
 
 		 336 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  40.36 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  40.18 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  39.16 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 347 aa  252  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  40.36 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  41.51 
 
 		 335 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  38.92 
 
 		 335 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  40.69 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  39.4 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  41.19 
 
 		 335 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  42.51 
 
 		 352 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  39.1 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  39.63 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  40.06 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  38.87 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  39.1 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  38.23 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  39.16 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  40.55 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  42.19 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  39.08 
 
 		 339 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  40.98 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  41.07 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  39.58 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  36.94 
 
 		 336 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  39.58 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.38 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.94 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  41.88 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  39.75 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  38.28 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  40.31 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  40.31 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  39.43 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 336 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  39.62 
 
 		 351 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  39.62 
 
 		 351 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>